Пакунок: ipig (0.0.r5-4 and others)

[ Source: ipig  ]

integrating PSMs into genome browser visualisations

iPiG targets the integration of peptide spectrum matches (PSMs) from mass spectrometry (MS) peptide identifications into genomic visualisations provided by genome browser such as the UCSC genome browser (http://genome.ucsc.edu/).

iPiG takes PSMs from the MS standard format mzIdentML (*.mzid) or in text format and provides results in genome track formats (BED and GFF3 files), which can be easily imported into genome browsers.

Інші пакунки пов'язані з ipig

• dep: libcommons-compress-java

  Java API for working with compression and archive formats

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - Java client API for basic Internet protocols

• dep: libjdom1-java

  lightweight and fast library using XML

• dep: libxerces2-java

  Аналізатор — валідатор XML для Java з підтримкою DOM level 3

Завантажити ipig

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	0.0.r5-4	160.9 kB	186.0 kB	[список файлів]
amd64	0.0.r5-4	160.9 kB	186.0 kB	[список файлів]
arm64	0.0.r5-4	160.9 kB	186.0 kB	[список файлів]
armel	0.0.r5-4	160.9 kB	186.0 kB	[список файлів]
armhf	0.0.r5-4	160.9 kB	186.0 kB	[список файлів]
i386	0.0.r5-4	160.9 kB	186.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	0.0.r5-4	160.9 kB	186.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	0.0.r5-4	161.0 kB	186.0 kB	[список файлів]
mips64el	0.0.r5-4	161.0 kB	186.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	0.0.r5-4	160.9 kB	186.0 kB	[список файлів]
ppc64el	0.0.r5-4	160.9 kB	186.0 kB	[список файлів]
riscv64	0.0.r5-4+b1	162.9 kB	189.0 kB	[список файлів]
s390x	0.0.r5-4	160.9 kB	186.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	0.0.r5-4	160.9 kB	186.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	0.0.r5-4	161.0 kB	186.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	0.0.r5-4	160.9 kB	186.0 kB	[список файлів]