Paquet : ipig (0.0.r5-5 et autres)

[ Paquet source : ipig  ]

intégration de PSM dans des visualisations de navigateur de génome

iPiG targets the integration of peptide spectrum matches (PSMs) from mass spectrometry (MS) peptide identifications into genomic visualisations provided by genome browser such as the UCSC genome browser (http://genome.ucsc.edu/).

iPiG takes PSMs from the MS standard format mzIdentML (*.mzid) or in text format and provides results in genome track formats (BED and GFF3 files), which can be easily imported into genome browsers.

Autres paquets associés à ipig

• dep: libcommons-compress-java

  Java API for working with compression and archive formats

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - Java client API for basic Internet protocols

• dep: libjdom1-java

  lightweight and fast library using XML

• dep: libxerces2-java

  validateur et analyseur XML pour Java avec la gestion de DOM niveau 3

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	0.0.r5-4	160,9 ko	186,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	0.0.r5-5	162,6 ko	188,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	0.0.r5-5	164,3 ko	189,0 ko	[liste des fichiers]