[ Source: debian-med ]
Package: med-bio (3.8.1)
Links for med-bio
Debian Resources:
Download Source Package debian-med:
Maintainers:
Similar packages:
Debian Med - pakker for bioinformatik
Denne metapakke vil installere Debianpakker til brug indenfor molekylær biologi, strukturel biologi og andre biologiske videnskaber.
Other Packages Related to med-bio
|
|
|
|
-
- dep: med-config (= 3.8.1)
- Debian Med - generel konfigurationspakke
-
- dep: med-tasks (= 3.8.1)
- Debian Med-opgaver for tasksel
-
- rec: abacas
- Luk huller i genomsammenligninger fra korte læsninger
-
- rec: abpoa
- Adaptiv båndet Partial Order Alignment
-
- rec: abyss
- De novo, parallel, sekvensassembler for korte læsninger
-
- rec: acedb-other
- Indhentelse af DNA- eller proteinsekvenser
-
- rec: adapterremoval
- Hurtig adaptertrimming, identifikation og læsesammenføjning af gensekvenser
-
- rec: adun-core
- Molekylær simulator
-
- rec: aegean
- Integreret værktøjssæt til analyse af arvemasse
-
- rec: aevol
- Digital genetisk model til at udføre evolutionseksperimenter i silico
-
- rec: alien-hunter
- Interpolated Variable Order Motifs til identificering af vandret indsamlede DNA
-
- rec: alter-sequence-alignment
- ALignment Transformation EnviRonment for arvemassesekvener
-
- rec: altree
- Program til at udføre fylogeni-baserede forenings- og lokaliseringsanalyse
-
- rec: amap-align
- Proteinflerjustering af sekvensudglødning
-
- rec: ampliconnoise
- Fjernelse af støj fra 454-sekvenserede PCR-amplicons
-
- rec: andi
- Effektiv estimering af evolutionære afstande
-
- rec: any2fasta
- Konverter diverse sekvensformater til FASTA
-
- rec: aragorn
- tRNA- og tmRNA-detektion i nukleotide sekvenser
-
- rec: arden
- Specificitetskontrol for læse sammenligninger ved anvendelse af en kunstig reference
-
- rec: ariba
- Antibiotic Resistance Identification By Assembly
-
- rec: art-nextgen-simulation-tools
- Simuleringsværktøjer til at oprette syntetiske næstegenerationssekventeringslæsninger
-
- rec: artemis
- Arvemassebrowser og annotationsværktøj
-
- rec: artfastqgenerator
- Viser kunstige FASTQ-filer afledt fra et referencegenom
-
- rec: assembly-stats
- Hent assembly-statistik fra FASTA- og FASTQ-filer
-
- rec: assemblytics
- Registrer og analyser strukturelle varianter fra en genomsamling
-
- rec: atac
- Samling til samling-sammenligning for genomer
-
- rec: ataqv
- ATAC-seq QC og visualisering
-
- rec: atropos
- NGS-læseoprydningsværktøj som er specifik, sensitiv og hurtig
-
- rec: augur
- Datakanalkomponenter for realtids viraanalyse
-
- rec: augustus
- Genforudsigelse i eukaryote genomer
-
- rec: autodock
- Analyse af ligand-binding til proteinstruktur
-
- rec: autodock-vina
- Dokning af små molekyler til proteiner
-
- rec: autogrid
- Beregn på forhånd liganders binding til deres receptor
-
- rec: avogadro
- Molekylært grafik- og modelsystem
-
- rec: axe-demultiplexer
- Trie-baseret DNA-sekventerende læsningsdemultiplexer
-
- rec: baitfisher
- Programpakke til design af hybride berigelsessonder
-
- rec: bali-phy
- Bayesiansk inferens for justering og fylogeni
-
- rec: ballview
- Frit værktøj til molekylærmodellering og molekylærgrafik
-
- rec: bamclipper
- Fjern gen-specifikke primer-sekvenser fra SAM/BAM-sammenligninger
-
- rec: bamkit
- Værktøjer for fælles BAM-filmanipulationer
-
- rec: bamtools
- Værktøjssæt for manipulering af BAM-filer - sammenligning af arvemasser
-
- rec: bandage
- Bioinformatikprogram til nemt at navigere de novo-samlingsgrafer
-
- rec: barrnap
- Hurtig ribosomal RNA-forudsigelse
-
- rec: bbmap
- BBTools - genom-sammenligningsprogram og andre værktøjer for korte sekvenser
-
- rec: bcalm
- De Bruijn-komprimering i lav hukommelse
-
- rec: bcftools
- Genomisk variantkald og manipulering af VCF/BCF-filer
-
- rec: beads
- 2-DE electrophoresis gel image spot-detektion
-
- rec: beagle
- Genotypekald, genotypefase og imputering af ikke genotype-markører
-
- rec: beast-mcmc
- Bayesiansk MCMC-fylogenetisk inferens
-
- rec: beast2-mcmc
- Bayesiansk MCMC-fylogenetisk inferens
-
- rec: bedops
- Højtydende genomisk funktionsoperationer
-
- rec: bedtools
- Programpakke med redskaber for sammenligning af arvemassefunktioner
-
- rec: belvu
- Fremviser for flere sekvenssammenligninger og et fylogenetisk værktøj
-
- rec: berkeley-express
- Strømkvantificering til sekventering med høj gennemløb
-
- rec: bio-eagle
- Haplotype-udfasning inden for en genotypekohorte eller ved hjælp af et trinvist henvisningspanel
-
- rec: bio-rainbow
- Klyngeopsætning og samling af korte læsninger for bioinformatik
-
- rec: bio-tradis
- Analyser resultatet fra TraDIS-analyser med genomsekvenser
-
- rec: bio-vcf
- Domain specific language (DSL) for behandling af VCF-formatet
-
- rec: bioawk
- Udvidelse af awk for biologisk sekvensanalyse
-
- rec: biobambam2
- Værktøjer for tidlig trin behandling af sammenligningsfil
-
- rec: biosyntax
- Syntaksfremhævelse for beregningsbiologi - metapakke
-
- rec: bitseq
- Bayesiansk udledning af transkripter fra sekvensdata
-
- rec: blasr
- Kortlægning af enkelte molekylesekventeringslæsninger
-
- rec: blixem
- Interaktiv browser for sekvenssammenligninger
-
- rec: bolt-lmm
- Effektiv stor kohorte-genom-bredt bayesiansk blandet-model tilknytningstest
-
- rec: bowtie
- Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
-
- rec: bowtie2
- Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
-
- rec: boxshade
- Pæn udskrift af flere sekvensersammenstillinger
-
- rec: bppphyview
- Bio++ Phylogenetic Viewer
-
- rec: bppsuite
- Programpakke for Bio++
-
- rec: brig
- BLAST Ring Image Generator
-
- rec: btllib-tools
- Bioinformatics Technology Lab - biblioteksværktøjer for fælles kode
-
- rec: busco
- Sammenligningssæt af universelle ortologer i en enkelt kopi
-
- rec: bustools
- Program til at manipulere BUS-filer for encellede RNA-seq-datasæt
-
- rec: bwa
- Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)
-
- rec: canu
- Enkel molekyle sekvenssamler for genomer
-
- rec: cassiopee
- Indeks- og søgeværktøj i arvemassesekvenser
-
- rec: cat-bat
- Taksonomisk klassifikation af contigs og metagenom-samlede genomer (MAG'er)
-
- rec: cct
- Visuelt sammenligne bakterie-, plasmid-, chloroplast- eller mitokondrie sekvenser
-
- rec: cd-hit
- Programpakke designet til hurtigt at gruppere sekvenser
-
- rec: cdbfasta
- Constant DataBase-indekserings- og indhentelsesværktøj for multi-FASTA-filer
-
- rec: centrifuge
- Hurtigt og hukommelseseffektivt system til klassifikation af DNA-sekvenser
-
- rec: cgview
- Cirkulær genomfremviser
-
- rec: changeo
- Repertoire klonal assignment toolkit - Python 3
-
- rec: chimeraslayer
- Detekterer sandsynlige kimærer i PCR-amplificeret DNA
-
- rec: chromhmm
- Kromatintilstandsregistrering og karakterisering
-
- rec: chromimpute
- Systematisk epigenom-imputation i stor skala
-
- rec: cif-tools
- Pakke af værktøjer til at manipulere, validere og forespørge mmCIF-filer
-
- rec: circlator
- Cirkularisere genomsamlinger
-
- rec: circos
- Plotprogram for visualisering af data
-
- rec: clearcut
- Ekstrem effektiv fylogenetisk trærekonstruktion
-
- rec: clonalframe
- Udledning af bakterisk mikroevolution med multilocus sekvensdata
-
- rec: clonalframeml
- Effektiv følgeslutning for rekombination i hele bakterielle genomer
-
- rec: clonalorigin
- Følgeslutning af homolog rekombination i bakterier ved anvendelse af hele genomsekvenser
-
- rec: clustalo
- Alment sekvenssammenligningsprogram for proteiner
-
- rec: clustalw
- Global nukleotid eller peptid sekvensjustering
-
- rec: clustalx
- Flere sammenligninger af nukledie syre- og proteinsekvenser - grafisk brugerflade
-
- rec: cnvkit
- Kopier nummervariantregistrering fra målrettet DNA-sekventering
-
- rec: codonw
- Korrespondanceanalyse af Codonanvendelse
-
- rec: comet-ms
- Tandem-massespektrometri (MS/MS) - søgemaskine
-
- rec: concavity
- Forudsigelse af proteinligandbindingssteder fra struktur og bevaring
-
- rec: conservation-code
- Værktøj til bedømmelse af bevaring af proteinsekvens
-
- rec: covtobed
- Konverter coverage-sporet fra en BAM-fil til en BED-fil
-
- rec: crac
- Integreret RNA-Seq-læsanalyse
-
- rec: csb
- Computational Structural Biology Toolbox (CSB)
-
- rec: cutadapt
- Rens biologiske sekvenser fra sekvenslæsninger med høj gennemløb
-
- rec: cutesv
- Omfattende registrering af strukturelle variationer af genomsekvenser
-
- rec: daligner
- Lokal tilpasningsregistrering mellem lange nukleotidsekventeringslæsninger
-
- rec: damapper
- Lang læsning til reference genom-oversættelsesværktøj
-
- rec: datamash
- Statistisk værktøj for kommandolinjegrænseflader
-
- rec: dawg
- Simuler udviklingen af rekombinante DNA-sekvenser
-
- rec: dazzdb
- Håndter data for nukleotidsekventeringslæsning
-
- rec: delly
- Strukturel variantregistrering af læseanalyse
-
- rec: density-fitness
- Beregner pr. rest elektrontæthedsbedømmelser
-
- rec: dextractor
- (Ud)pakker og kompressionskommandobibliotek
-
- rec: dialign
- Segmentbaseret flersekvensjustering
-
- rec: dialign-tx
- Segmentbaseret flersekvensjustering
-
- rec: diamond-aligner
- Accelereret BLAST-kompatibel lokal sekvenssammenligner
-
- rec: discosnp
- Find enkel nukleotidpolymorfisme fra rå læsning af sæt
-
- rec: disulfinder
- Cysteines disulfidbindingtilstand og forbindelsesprædiktor
-
- rec: dnaclust
- Værktøj til klyngedannelse af korte DNA-sekvenser
-
- rec: dnarrange
- Metode til at finde omlægninger i lange DNA-læsninger relativt til en genomsekvens
-
- rec: dotter
- Detaljeret sammenligning af to genomsekvenser
-
- rec: drop-seq-tools
- Analyse af drop-seq-data
-
- rec: dssp
- Sekundære proteinstruktur-opgave baseret på 3D-struktur
-
- rec: dwgsim
- Simulator til kort sekventeringslæsninger
-
- rec: e-mem
- Effektiv beregning af Maximal Exact Matches for meget store genomer
-
- rec: ea-utils
- Værktøjer til kommandolinjen for behandling af biologiske sekvensdata
-
- rec: ecopcr
- Estimer PCR-stregkodeprimers kvalitet
-
- rec: edtsurf
- Triangulerede mesh-overflader til proteinstrukturer
-
- rec: eigensoft
- Reduktion af befolkningsbias for genetiske analyser
-
- rec: elph
- DNA/protein-sekvens motif finder
-
- rec: embassy-domainatrix
- Ekstra EMBOSS-kommandoer til håndtering af domæneklassifikationsfil
-
- rec: embassy-domalign
- Ekstra EMBOSS-kommandoer til proteindomæne-justering
-
- rec: embassy-domsearch
- Ekstra EMBOSS-kommandoer til søgning i proteindomæner
-
- rec: emboss
- Programpakke til europæisk molekylærbiologi
-
- rec: emmax
- Genetisk oversættelse der tager højde for populationsstruktur
-
- rec: estscan
- ORF-uafhængig detektor for kodning af DNA-sekvenser
-
- rec: examl
- Exascale Maximum Likelihood-kode (ExaML) for fylogenetisk følgeslutning
-
- rec: exonerate
- generisk værktøj til parvis sekvenssammenligning
-
- rec: fasta3
- Værktøjer til at søge i samlinger med biologiske sekvenser
-
- rec: fastahack
- Redskab for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer
-
- rec: fastani
- Hurtig sammenligningsfri beregning af whole-genome Average Nucleotide Identity
-
- rec: fastaq
- Manipuleringsværktøjer til FASTA- og FASTQ-filer
-
- rec: fastdnaml
- Værktøj for konstruktion af fylogentiske træer for DNA-sekvenser
-
- rec: fastlink
- Hurtigere version af pedigree-programmer for Linkage
-
- rec: fastml
- Maximum likelihood-nedarvet aminosyresekvensgenopbygning
-
- rec: fastp
- Ultrahurtig alt i en FASTQ-forbrænder
-
- rec: fastq-pair
- Genskriver paried end-fastq så alle læsninger har en partner til at udskille singletons
-
- rec: fastqc
- Kvalitetskontrol for høj gennemløb af sekvensdata
-
- rec: fastqtl
- Quantitative Trait Loci-oversætter (QTL) i cis for molekylære fænotyper
-
- rec: fasttree
- Fylogenetiske træer fra opstillinger af nukleotid- eller proteinsekvenser
-
- rec: ffindex
- Simpelt indeks/database for store mængder af små filer
-
- rec: figtree
- Grafisk fylogenetisk træfremviser
-
- rec: filtlong
- Kvalitetsfiltreringsværktøj for lange læsninger af genomsekvenser
-
- rec: fitgcp
- Tilpasning af arvemasse-dækningsdistributioner med blandingsmodeller
-
- rec: flash
- Fast Length Adjustment of SHort reads
-
- rec: flexbar
- Fleksibel stregkode og adapterfjernelse for sekvensplatforme
-
- rec: flye
- De novo-samler for enkeltt molekylær sekventeringslæsninger via repeat-grafer
-
- rec: fml-asm
- Værktøj til at samle Illuminakorte læsninger i små områder
-
- rec: freebayes
- Bayesian haplotype-baseret polymorfiregistrering og genotypebestemmelse
-
- rec: freecontact
- Hurtig protein-kontaktprædiktor
-
- rec: fsa
- Hurtig statistisk sammenligning af protein-, RNA- eller DNA-sekvenser
-
- rec: fsm-lite
- Frekvensbaseret strengminering - lite
-
- rec: gamgi
- General Atomistic Modelling Graphic Interface (GAMGI)
-
- rec: garli
- Fylogenetisk analyse af molekylære sekvensdata der bruger maximum-likelihood
-
- rec: garlic
- Visualiseringsprogram for biomolekyler
-
- rec: gasic
- Lighedskorrektion for arvemasseoverflod
-
- rec: gatb-core
- Genomanalyseværktøjskasse med de-Bruijn-graf
-
- rec: gbrowse
- GMOD Generic Genome Browser
-
- rec: gdpc
- visualiseringsprogram til simulering af molekylær dynamik
-
- rec: gemma
- Genome-wide Efficient Mixed Model Association
-
- rec: genometester
- Værktøjssæt til at udføre sætoperationer på k-mer-lister
-
- rec: genomethreader
- Programværktøj til at beregne genstrukturforudsigelser
-
- rec: genometools
- Alsidigt værktøjs til arvemasseanalyse
-
- rec: genomicsdb-tools
- Rumligt tabellagerbibliotek for genomics - værktøjer
-
- rec: gentle
- Programpakke til molekylær kloning og sekvensanalyse
-
- rec: gff2aplot
- Parvise justeringsplot for arvemassesekvenser i PostScript
-
- rec: gff2ps
- laver PostScript-grafisk uddata fra GFF-filer
-
- rec: gffread
- GFF/GTF-formatkonverteringer, regionsfiltrering, FASTA-sekvensudtræk
-
- rec: ggd-utils
- Programmer til brug i ggd
-
- rec: ghemical
- Modelleringsmiljø for molekyler til GNOME
-
- rec: ghmm
- Generelt Hidden-Markov-Model-bibliotek - værktøjer
-
- rec: glam2
- Proteinmotiver med afstand fra ikke-justerede sekvenser
-
- rec: gmap
- Opdelt og SNP-overholdende justering for mRNA og korte læsninger
-
- rec: grabix
- Wee-værktøj for vilkårlig adgang i BGZF-filer
-
- rec: graphlan
- Cirkulære repræsentationer af taksonomiske og fylogenetiske træer
-
- rec: grinder
- Alsidige omics shotgun og amplikon sekventeringslæsningssimulator
-
- rec: gromacs
- Simulator af molekyldynamik med bygge- og analyseværktøjer
-
- rec: gsort
- Sorter genomiske data
-
- rec: gubbins
- Fylogenetisk analyse af genomsekenser
-
- rec: gwama
- Genome-Wide Association Meta Analysis
-
- rec: harvest-tools
- Arkivering og efterbehandling for referencekomprimerede genomiske fler-justeringer
-
- rec: hhsuite
- Sensitiv proteinsekvenssøgning baseret på HMM-HMM-sammenligning
-
- rec: hilive
- Realtid sammenligning af Illumina-læsninger
-
- rec: hinge
- Assembler til læsning af lange genomer baseret på hinging
-
- rec: hisat2
- Grafbaseret sammenligning af korte nukleoide læsninger for mange genomer
-
- rec: hmmer
- Profilskjulte Markov-modeller for proteinsekvensanalyse
-
- rec: hmmer2
- Profilskjulte Markov-modeller for proteinsekvensanalyse
-
- rec: idba
- Iterativ De Bruijn Graph De Novo-kortlæserassemblere
-
- rec: igblast
- Immunoglobulin og T-cellereceptor variabelt domænesekvensanalyse
-
- rec: igor
- Infers V(D)J-rekombinationsproces fra sekvensdata
-
- rec: igv
- Integrative Genomics Viewer
-
- rec: indelible
- Funktionsrig og fleksibel simulator for biologisk evolution
-
- rec: infernal
- Logisk slutning for RNA-sekundære struktursammenligninger
-
- rec: insilicoseq
- Sekventeringssimulator der fremstiller realistiske Illumina-læsninger
-
- rec: ipig
- Integrering af PSM'er til arvemassebrowservisualiseringer
-
- rec: iqtree
- Effektivt fylogenetisk program ved maksimal sandsynlighed
-
- rec: iva
- Iterativ virussekvensassembler
-
- rec: jaligner
- Smith-Waterman-algoritme med Gotohs forbedring
-
- rec: jalview
- Redigeringsprogram for flere sammenligninger
-
- rec: jellyfish
- Tæl k-mers i DNA-sekvenser
-
- rec: jellyfish1
- Tæl k-mers i DNA-sekvenser
-
- rec: jmodeltest
- HPC-udvalg af modeller for nukleotid substitution
-
- rec: jmol
- Molekylær fremviser
-
- rec: kalign
- Global og progressiv flersekvensjustering
-
- rec: kallisto
- Næsten optimal RNA-Seq-kvantificering
-
- rec: kaptive
- Indhent information om K- og O-typer for Klebsiella-genomsamlinger
-
- rec: khmer
- I-hukommelse DNA-sekvens kmer-optælling, filtrering og grafgennemløb
-
- rec: kineticstools
- Detektion af DNA-ændringer
-
- rec: king-probe
- Evaluer og visualiser pakning af proteiners interne atomare opbygning
-
- rec: kissplice
- Detektion af diverse slags polymorfismer i RNA-sekvensdata
-
- rec: kleborate
- Værktøj til at screene Klebsiella-genomsamlinger
-
- rec: kma
- Sammenlign genomsekvenser med rå læsninger direkte mod redundante databaser
-
- rec: kmc
- Tæl kmers i arvemassesekvenser
-
- rec: kmer
- Programpakke med værktøjer for DNA-sekvensanalyse
-
- rec: kmerresistance
- Korrelerer kortlagte gener med de forudsagte arter for WGS-prøver
-
- rec: kraken
- Tildeling af taksonomiske etiketter til korte DNA-sekvenser
-
- rec: kraken2
- Taksonomisk klassifikationssystem der bruger præcise k-mer-træffere
-
- rec: lagan
- Parameteropsat parvist og globalt sammenligningsprogram for genomsekvenser
-
- rec: lamarc
- Sandsynlighedsanalyse med Metropolisalgoritme via tilfældig sammenblanding
-
- rec: lamassemble
- Merges overlapping "long" DNA reads into a consensus sequences
-
- rec: lambda-align
- Lokal sammenligningsprogram for Massive Biological DatA
-
- rec: lambda-align2
- Local Aligner for Massive Biological DatA - version 2
-
- rec: last-align
- sammenligning af biologisk sekvenser på genom-skala
-
- rec: lastz
- Parvis sammenligning af DNA-sekvenser
-
- rec: leaff
- Redskaber og programmer for biologisk sekvensbibliotek
-
- rec: lefse
- Bestem funktioner for organismer, grupper, taksonomiske enheder, gener
-
- rec: libpwiz-tools
- ProteoWizard - kommandolinjeværktøjer
-
- rec: librg-utils-perl
- Fortolkere og redskaber til formatkonvertering brugt af (f.eks.) profphd
-
- rec: libvcflib-tools
- C++-bibliotek til at fortolke og manipulere VCF-filer - værktøjer
-
- rec: lighter
- Hurtig og hukommelseseffektiv program til rettelse af sekventeringsfejl
-
- rec: logol
- Package not available
-
- rec: loki
- MCMC-koblingsanalyse vedrørende generelle stamtavler
-
- rec: ltrsift
- Efterbehandling og klassifikation af LTR-retrotransposons
-
- rec: lucy
- DNA-værktøj til sekvenskvalitet og vektortrimning
-
- rec: lumpy-sv
- Generel sandsynlighedsramme for strukturel variantregistrering
-
- rec: macs
- Modelbaseret analyse af ChIP-Seq på korte læsesekvenser
-
- rec: macsyfinder
- Registrering af makromolekylære systemer i proteindatasæt
-
- rec: maffilter
- Behandl genomsammenligning i Multiple Alignment Format
-
- rec: mafft
- Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser
-
- rec: malt
- sequence alignment and analysis tool to process sequencing data
-
- rec: mapdamage
- tracking and quantifying damage patterns in ancient DNA sequences
-
- rec: mapsembler2
- Bioinformatik målrettet programmer til samling
-
- rec: maq
- kortlægger korte, fast-længde, polymorfiske DNA-sekvenslæsninger til reference-sekvenser
-
- rec: maqview
- Grafisk fremviser for læsesammenligninger for korte gensekvenser
-
- rec: mash
- Hurtig genom- og metagenomafstandsestimering via MinHash
-
- rec: massxpert
- Overgangspakke for massxpert -> massxpert2
-
- rec: mauve-aligner
- Sammenligning af flere genomer
-
- rec: mcaller
- find methylation in nanopore reads
-
- rec: mecat2
- ultra-fast and accurate de novo assembly tools for SMRT reads
-
- rec: megadepth
- computes coverage from BigWig and BAM sequencing files
-
- rec: megahit
- ultra-fast and memory-efficient meta-genome assembler
-
- rec: megan-ce
- interactive tool to explore and analyse microbiome sequencing data
-
- rec: melting
- beregn smeltepunktet for nukleinsyre-duplekser
-
- rec: meryl
- Tælning og redskaber til ind og ud af kerne i kmer
-
- rec: metabat
- Robust statistisk ramme for rekonstruktion af genomer fra metagenomiske data
-
- rec: metaphlan
- Metagenomic Phylogenetic Analysis
-
- rec: metastudent
- Indikator for genontologivilkår fra proteinsekvens
-
- rec: mhap
- Lokalitetsfølsom hashing for at registrere long-read-overlap
-
- rec: microbegps
- Udforskende taksonomisk profileringsværktøj til metagenomiske data
-
- rec: microbiomeutil
- Microbiome - analyseredskaber
-
- rec: mindthegap
- performs detection and assembly of DNA insertion variants in NGS read datasets
-
- rec: minexpert2
- MS^n-massespektrometrisk datavisualisering og mining - kørselstid
-
- rec: minia
- Kort-læst biologisk sekvensamler
-
- rec: miniasm
- Ultrahurtig de novo assembler for lange støjfyldte DNA-sekvenslæsninger
-
- rec: minimac4
- Fast Imputation baseret på State Space Reduction HMM
-
- rec: minimap
- Værktøj til omtrentlig oversættelse af lange biosekvenser såsom DNA-læsninger
-
- rec: minimap2
- Alsidig parvis sammenligner for genomiske og opdelte nukleotide sekvenser
-
- rec: mipe
- Værktøjer til at gemme PCR-afledte data
-
- rec: mira-assembler
- Hel Genome Shotgun og EST Sequence Assembler
-
- rec: mirtop
- Mærk miRNA'er med et standardnavn mirna/isomir
-
- rec: mlv-smile
- Find statistisk signifikante mønstre i sekvenser
-
- rec: mmb
- Modelopbyg strukturen og dynamikkerne for makromolekyler
-
- rec: mmseqs2
- Ultra hurtig og sensitiv proteinsøgning og klyngeopbygning
-
- rec: mosdepth
- BAM/CRAM depth calculation biological sequencing
-
- rec: mothur
- Programpakke for sekvensanalyse til forskning i mikrobiota
-
- rec: mptp
- single-locus species delimitation
-
- rec: mrbayes
- Bayesiansk inferens for fylogeni
-
- rec: multiqc
- Vis integration for RNS-sekventering på tværs af værktøjer og prøver
-
- rec: mummer
- Effektiv sekvensjustering for hele genomer
-
- rec: murasaki
- Detektionsværktøj for homologi på tværs af flere store genomer
- or murasaki-mpi
- Afsløringsværktøj for homologi på tværs af flere store genomer - MPI-udgave
-
- rec: muscle
- Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser
-
- rec: muscle3
- Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser
-
- rec: mustang
- Strukturel justering på flere måder af proteiner
-
- rec: nanofilt
- filtering and trimming of long read sequencing data
-
- rec: nanolyse
- remove lambda phage reads from a fastq file
-
- rec: nanook
- pre- and post-alignment analysis of nanopore sequencing data
-
- rec: nanopolish
- Konsensuskalder for nanopore-sekvensdata
-
- rec: nanostat
- Statistik på lange biologiske sekvenser
-
- rec: nanosv
- Strukturel variantkalder for nanopore-data
-
- rec: nast-ier
- NAST-baseret DNA-sammenligningsværktøj
-
- rec: ncbi-acc-download
- Hent genomfiler fra NCBI ved tiltrædelse
-
- rec: ncbi-blast+
- Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer
-
- rec: ncbi-blast+-legacy
- NCBI Blast-forældet kaldskript
-
- rec: ncbi-entrez-direct
- NCBI Entrez-redskaber på kommandolinjen
-
- rec: ncbi-epcr
- Værktøj til at teste en DNA-sekvens for tilstedeværelsen af sekvensmærkede steder
-
- rec: ncbi-seg
- tool to mask segments of low compositional complexity in amino acid sequences
-
- rec: ncbi-tools-bin
- NCBI-biblioteker for biologiprogrammer - tekstbaserede redskaber
-
- rec: ncbi-tools-x11
- NCBI-biblioteker for biologiprogrammer - X-baserede redskaber
-
- rec: ncl-tools
- Værktøj til at håndtere NEXUS-filer
-
- rec: ncoils
- Coiled coil - sekundær strukturforudsigelse
-
- rec: neobio
- Beregner opstillinger af aminosyre- og nukleotidsekvenser
-
- rec: ngmlr
- CoNvex Gap-cost alignMents for Long Reads
-
- rec: njplot
- Fylogenetisk trætegningsprogram
-
- rec: norsnet
- tool to identify unstructured loops in proteins
-
- rec: norsp
- predictor of non-regular secondary structure
-
- rec: ntcard
- Strømalgoritme til at estimere kardinalitet i genomiske datasæt
-
- rec: nxtrim
- Optimeret justering af Illumina mate-parlæsninger
-
- rec: obitools
- Programmer til at analysere NGS-data i en DNA-metabarcoding-kontekst
-
- rec: openms
- Pakke for LC/MS-datahåndtering og -analyse
-
- rec: optimir
- Integration af genetiske varianter i miRNA-sammenligning
-
- rec: pal2nal
- Konverterer proteiner til genomisk DNA-sammenligning
-
- rec: paleomix
- Datakanaler og værktøjer til at behandle ældre og moderne HTS-data
-
- rec: paml
- Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood (PAML)
-
- rec: paraclu
- Parametrisk klyngedannelse af genomiske og transkriptomfunktioner
-
- rec: parasail
- Sammenligning baseret på libparasail
-
- rec: parsinsert
- Påholdende Indsættelse af uklassificerede sekvenser i fylogenetiske træer
-
- rec: parsnp
- Hurtig grundlæggende gensammenligning
-
- rec: patman
- Hurtig sammenligning af korte sekvenser med store databaser
-
- rec: pbdagcon
- sequence consensus using directed acyclic graphs
-
- rec: pbhoney
- genomic structural variation discovery
-
- rec: pbjelly
- genome assembly upgrading tool
-
- rec: pbsim
- Simulator for PacBio-sekvenslæsninger
-
- rec: pbsuite
- Program for Pacific Biosciences-sekvensdata
-
- rec: pdb2pqr
- Præparation af proteinstrukturer for elektrostatiske beregninger
-
- rec: perlprimer
- Grafisk design af primere for PCR
-
- rec: perm
- Effektiv kortlægning af korte læsninger med periodiske fordelte seedninger
-
- rec: pftools
- Byg og søg protein- og DNA-generaliserede profiler
-
- rec: phast
- phylogenetic analysis with space/time models
-
- rec: phipack
- PHI-test og andre test med rekombination
-
- rec: phybin
- binning/clustering newick trees by topology
-
- rec: phylip
- Programpakke for udledning af fylogenier
-
- rec: phylonium
- Hurtig og præcis estimering af evolutionære afstande
-
- rec: phyml
- Fylogenisk estimering der bruger maksimum lIkelihood
-
- rec: physamp
- sample sequence alignment corresponding to phylogeny
-
- rec: phyutility
- simple analyses or modifications on both phylogenetic trees and data matrices
-
- rec: phyx
- Fylogenetiske analyser på træer og sekvenser i UNIX-stil
-
- rec: picard-tools
- Kommandolinjeværktøjer til at manipulere SAM- og BAM-filer
-
- rec: picopore
- Kompression uden kvalitetstab af Nanopore-filer
-
- rec: pigx-rnaseq
- pipeline for checkpointed and distributed RNA-seq analyses
-
- rec: piler
- Genomisk gentagelsesanalyse
-
- rec: pilercr
- Program til at finde CRISPR-gentagelser
-
- rec: pilon
- automated genome assembly improvement and variant detection tool
-
- rec: pinfish
- Collection of tools to annotate genomes using long read transcriptomics data
-
- rec: pique
- software pipeline for performing genome wide association studies
-
- rec: pirs
- Profilbaseret Illumina-læsesimulator for pair-end
-
- rec: pizzly
- Identificerer genfusioner i RNA-sekventeringsdata
-
- rec: placnet
- Plasmid Constellation Network-projekt
-
- rec: plasmidid
- mapping-based, assembly-assisted plasmid identification tool
-
- rec: plasmidomics
- Tegn plasmider og vektorkort med PostScript-grafikeksport
-
- rec: plasmidseeker
- identification of known plasmids from whole-genome sequencing reads
-
- rec: plast
- Parallel Local Sequence Alignment Search Tool
-
- rec: plink
- Værktøjssæt til associationsanalyse for hele genomer
-
- rec: plink1.9
- Værktøjssæt til associationsanalyse for hele genomer
-
- rec: plink2
- Værktøjssæt til associationsanalyse for hele genomer
-
- rec: plip
- fully automated protein-ligand interaction profiler
-
- rec: poa
- Partial Order Alignment for flere sekvenssammenligninger
-
- rec: populations
- Program til befolkningsgenetik
-
- rec: porechop
- Adaptertrimmer for Oxford Nanopore-læsninger
-
- rec: poretools
- Værktøjssæt til nanopores nukleotidsekventeringsdata
-
- rec: prank
- Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences
-
- rec: predictnls
- Forudsigelse og analyse af proteinnukleare lokaliseringssignaler
-
- rec: presto
- Værktøjssæt til at behandle B- og T-cellesekvenser
-
- rec: prime-phylo
- Bayesiansk estimation af gentræer der tager højde for artstræet
-
- rec: primer3
- Værktøj til at designe flankerende, oligo-nukleotider til DNA-amplifikation
-
- rec: prinseq-lite
- PReprocessing and INformation of SEQuence data (lite version)
-
- rec: proalign
- Probabilistic multiple alignment program
-
- rec: probabel
- Værktøjssæt for Genome-Wide Association Analysis
-
- rec: probalign
- Multiple sekvensjustering med brug partitionsfunktionel posteriore sandsynligheder
-
- rec: probcons
- Flersekvens-sammenstilling baseret på probabilistisk konsistens (PROBabilistic CONSistency)
-
- rec: proda
- multi-sammenligning af protein-sekvenser
-
- rec: prodigal
- Mikrobiel (bakteriel og archaeorganisme) genkonstateringsprogram
-
- rec: profbval
- Forudsigelse for fleksible/stive proteinrester fra sekvens
-
- rec: profisis
- Forudsigelse af protein-protein interaktionssider fra sekvens
-
- rec: profnet-bval
- Neural netværksarkitektur for profbval
-
- rec: profnet-chop
- Neural netværksarkitektur for profchop
-
- rec: profnet-con
- Neural netværksarkitektur for profcon
-
- rec: profnet-isis
- Neural netværksarkitektur for profisis
-
- rec: profnet-md
- Neuralt netværksarkitektur for metadisorder
-
- rec: profnet-norsnet
- Neural netværksarkitektur for norsnet
-
- rec: profnet-prof
- Neural netværksarkitektur for profacc
-
- rec: profnet-snapfun
- Neural netværksarkitektur for snapfun
-
- rec: profphd-net
- Neural netværksarkitektur for profphd
-
- rec: profphd-utils
- Profphd-hjælperedskaberne convert_seq og filter_hssp
-
- rec: proftmb
- Per rest forudsigelse af bakterielle transmembrane beta-tønder
-
- rec: progressivemauve
- Sammenligningsalgoritmer for flere genomer
-
- rec: prokka
- Hurtig annotaton af prokaryotiske genomer
-
- rec: proteinortho
- Registrering af (Co-)ortologer i storskala proteinanalyse
-
- rec: prottest
- selection of best-fit models of protein evolution
-
- rec: provean
- Protein Variation Effect Analyzer
-
- rec: pscan-chip
- ChIP-based identifcation of TF binding sites
-
- rec: pscan-tfbs
- search for transcription factor binding sites
-
- rec: psortb
- Forudsigelsesværktøj for lokalisering af bakterier
-
- rec: pullseq
- Udtræk sekvens fra en fasta eller fastq
-
- rec: pycoqc
- computes metrics and generates Interactive QC plots
-
- rec: pycorrfit
- Værktøj for tilpasning af korrelationskurver på et logaritmisk plot
-
- rec: pyensembl
- installs data from the Ensembl genome database
-
- rec: pyfastx
- Hurtig vilkårlig adgang til sekvenser fra FASTA/Q-fil - kommando
-
- rec: pymol
- System til molekylærgrafik
-
- rec: pyscanfcs
- Videnskabeligt værktøj til vinkelret linjeskanning FCS
-
- rec: python3-biomaj3-daemon
- BioMAJ-dæmonbibliotek
-
- rec: python3-cogent3
- Ramme for genomisk biologi
-
- rec: python3-emperor
- visualizing high-throughput microbial community data
-
- rec: python3-geneimpacts
- Omslutter kommandolinjeværktøjer for at tilgå varianter i gensekvenser
-
- rec: python3-gffutils
- Arbejd med GFF- og GTF-filer i en fleksibel databaseramme
-
- rec: python3-pairtools
- Ramme til at behandle sekventeringsdata fra et Hi-C-eksperiment
-
- rec: python3-pybedtools
- Python 3-omslag omkring BEDTools for bioinformatikarbejde
-
- rec: python3-sqt
- SeQuencing-værktøjer for biologiske DNA/RNA-data med høj gennemløb
-
- rec: python3-treetime
- Inferens af tidsstemplede fylogenier og forfædres rekonstruktion - Python 3
-
- rec: pyvcf
- Hjælpeskripter for Variant Call Format-fortolkeren (VCF)
-
- rec: qcat
- Demultiplexing Oxford Nanopore-læsninger fra FASTQ-filer
-
- rec: qcumber
- Kvalitetskontrol af genomsekvenser
-
- rec: qiime
- Kvantitativ indsigt i mikrobiel økologi
-
- rec: qtltools
- Værktøjssæt for molekylær QTL-registrering og analyse
-
- rec: quicktree
- Neighbor-Joining-algoritme for fylogenier
-
- rec: quorum
- QUality Optimized Reads of genomic sequences
-
- rec: qutemol
- interaktiv visualisering af makromolekyler
-
- rec: r-bioc-annotate
- BioConductor-annotation for microarray'er
-
- rec: r-bioc-biostrings
- GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser
-
- rec: r-bioc-cner
- CNE-registrering og visualisering
-
- rec: r-bioc-cummerbund
- Værktøjer for analyse af Cufflinks RNA-Seq-uddata
-
- rec: r-bioc-deseq2
- R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse
-
- rec: r-bioc-ebseq
- R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse
-
- rec: r-bioc-edger
- Empirisk analyse af digitale gen-udtryksdata i R
-
- rec: r-bioc-genefilter
- Metoder for filtrering af gener fra microarray-eksperimenter
-
- rec: r-bioc-geoquery
- Hent data fra NCBI Gene Expression Omnibus (GEO)
-
- rec: r-bioc-hilbertvis
- GNU R-pakke til at visualisere lange vektordata
-
- rec: r-bioc-htsfilter
- GNU R-filter replikeret høj-gennemløb transkriptom sekventeringsdata
-
- rec: r-bioc-impute
- Imputering for microarray-data
-
- rec: r-bioc-limma
- Lineære modeller for microarray-data
-
- rec: r-bioc-megadepth
- BioCOnductor BigWig og BAM-relaterede redskaber
-
- rec: r-bioc-mergeomics
- Integrerende netværksanalyse af omics-data
-
- rec: r-bioc-metagenomeseq
- GNU R-statistisk analyse for tynd høj-gennemløb sekventering
-
- rec: r-bioc-mofa
- Multi-Omics Factor Analysis (MOFA)
-
- rec: r-bioc-multiassayexperiment
- Program for integration af multi-omics-eksperimenter i BioConductor
-
- rec: r-bioc-mutationalpatterns
- GNU R-omfattende genom-udbredt analyse af mutationsprocesser
-
- rec: r-bioc-pcamethods
- BioConductor-samling af PCA-metoder
-
- rec: r-bioc-phyloseq
- GNU R-håndtering og analyse af høj-gennemløb microbiome censusdata
-
- rec: r-bioc-rtracklayer
- GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor
-
- rec: r-bioc-scater
- Enkelt-celle analyseværktøjssæt for genudtryksdata i R
-
- rec: r-bioc-tfbstools
- GNU R Transcription Factor Binding Site (TFBS) Analysis
-
- rec: r-cran-adegenet
- GNU R-undersøgende analyse af genetisk og genomdata
-
- rec: r-cran-adephylo
- GNU R-sonderende analyser for den fylogenetiske kompatrative metode
-
- rec: r-cran-alakazam
- Immunoglobulin Clonal Lineage og Diversity Analysis
-
- rec: r-cran-ape
- GNU R-pakke for Analyses of Phylogenetics and Evolution
-
- rec: r-cran-bio3d
- GNU R-pakke for biologisk strukturanalyse
-
- rec: r-cran-distory
- GNU R-afstand mellem fylogenetiske historier
-
- rec: r-cran-genabel
- GNU R package for genome-wide SNP association analysis
-
- rec: r-cran-kaos
- Kodning af sekvenser baseret på Frequency Matrix Chaos
-
- rec: r-cran-metamix
- GNU R - bayesiansk blandingsanalyse for metagenomisk fællesskabsprofilering
-
- rec: r-cran-phangorn
- GNU R-pakke for fylogenetisk analyse
-
- rec: r-cran-phytools
- GNU R-fylogenetiske værktøjer til komparativ biologi
-
- rec: r-cran-pscbs
- R-pakke - analyse af overordnede og specifikke DNA-kopinumre
-
- rec: r-cran-qtl
- GNU R-pakke for genetisk markørbindingsanalyse
-
- rec: r-cran-rotl
- GNU R-grænseflade til »Open Tree of Life«-API'en
-
- rec: r-cran-samr
- GNU R-signifikansanalyse af mikrotabeller
-
- rec: r-cran-sdmtools
- Species Distribution Modelling Tools
-
- rec: r-cran-seqinr
- GNU R-biologiske sekvenser - indhentelse og analyse
-
- rec: r-cran-seurat
- Værktøjer for enkel celle genomik
-
- rec: r-cran-shazam
- Immunoglobulin somatisk hypermutationsanalyse
-
- rec: r-cran-spp
- GNU R ChIP-seq processing pipeline
-
- rec: r-cran-tcr
- Avanceret dataanalyse af Immune Receptor Repertoires
-
- rec: r-cran-tigger
- Udleder nye immunoglobulin-alleler fra Rep-Seq-data
-
- rec: r-cran-treescape
- Package not available
-
- rec: r-cran-tsne
- T-distribueret stokastisk naboindlejring for R (t-SNE)
-
- rec: r-cran-vegan
- Fællesskabsøkologi for R
-
- rec: r-cran-webgestaltr
- Find overrepræsenterede egenskaber i gen-lister
-
- rec: r-cran-wgcna
- Vægtet korrelationsnetværksanalyse
-
- rec: r-other-ascat
- Allele-Specific Copy Number Analysis of Tumours
-
- rec: r-other-mott-happy.hbrem
- GNU R-pakke for finkortlægning af komplekse sygdomme
-
- rec: r-other-rajewsky-dropbead
- Grundlæggende udforskning og analyse af Drop-seq-data
-
- rec: racon
- consensus module for raw de novo DNA assembly of long uncorrected reads
-
- rec: radiant
- Udforsk hierarkiske metagenomdata med lagkagediagrammer
-
- rec: ragout
- Reference-Assisted Genome Ordering UTility
-
- rec: rambo-k
- Read Assignment Method Based On K-mers
-
- rec: rampler
- Modul for sampling-genomiske sekvenser
-
- rec: rapmap
- Hurtig sensitiv og præcis DNA-læsningsoversættelse via quasi-mapping
-
- rec: rasmol
- Visualisering af biologiske makromolekyler
-
- rec: raster3d
- Værktøjer for oprettelse af billeder for proteiner eller andre molekyler
-
- rec: rate4site
- Detektor af konserverede aminosyresteder
-
- rec: raxml
- Randomized Axelerated Maximum Likelihood for pylogenetiske træer
-
- rec: ray
- de novo genome assemblies of next-gen sequencing data
-
- rec: rdp-alignment
- Ribosomal Database Project (RDP) værktøjspakke for sammenligning
-
- rec: rdp-classifier
- Udvidelig sekvensklassifikation for fungal lsu, bakterie og arkæisk 16s
-
- rec: rdp-readseq
- Ribosomal Database Project (RDP) sequence reading and writing
-
- rec: readseq
- Konvertering mellem sekvensformater
-
- rec: readucks
- Nanopore read de-multiplexer (read demux -> readux -> readucks, innit)
-
- rec: reapr
- Universielt værktøj for genomsamlingsevaluering
-
- rec: recan
- Genetisk afstandsplot for analyse af rekombinationshændelser
-
- rec: relion
- Værktøjssæt for 3D-rekonstruktioner i cryo-elektron mikroskopi
-
- rec: relion-gui
- Værktøjssæt for 3D-rekonstruktioner i kryo-elektron mikroskopi - grafiske programmer
-
- rec: repeatmasker-recon
- finds repeat families from biological sequences
-
- rec: reprof
- Proteinsekundær struktur- og tilgængelighedsprædiktor
-
- rec: resfinder
- Identificer erhvervede antimikrobielle resistensgener
-
- rec: rna-star
- Ultrahurtig univerel RNA-seq-sammenligningsprogram
-
- rec: rnahybrid
- Hurtig og effektiv forudsigelse om microRNA-/mål-dubletter
-
- rec: roary
- Højhastigheds og uafhængig pan-genomdatakanal
-
- rec: rockhopper
- System til at analysere bakterielle RNA-seq-data
-
- rec: roguenarok
- Alsidig og skalerbar algoritmer for rogue taxon-identifikation
-
- rec: rsem
- RNA-Seq ved Expectation-Maximization
-
- rec: rtax
- Klassifikation af sekvenslæsninger for 165 ribosomal RNA-gen
-
- rec: runcircos-gui
- Grafisk brugerfladeværktøj til at afvikle circos
-
- rec: saint
- Significance Analysis of INTeractome
-
- rec: salmid
- Hurtig Kmer-baseret Salmonella-identifikator fra sekvensdata
-
- rec: salmon
- Wicked-hurtig transskriptkvantificering fra RNA-seq-data
-
- rec: sambamba
- Værktøjer for arbejde med SAM/BAM-data
-
- rec: samblaster
- Markerer dubletter, udtrækker discordant/split-læsninger
-
- rec: samclip
- Filtrer SAM-fil for blødt og hårdt klippet sammenligninger
-
- rec: samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
-
- rec: savvy-util
- Konverteringsværktøj for SAV-filformatet
-
- rec: scoary
- Pangenom-brede associationsstudier
-
- rec: scrappie
- Basiskalder for sekventeringsprogrammet Nanopore
-
- rec: scrm
- Simulator af evolution for genetiske sekvenser
-
- rec: scythe
- Byesiansk adaptortrimmer for sekvenslæsninger
-
- rec: seaview
- Grænseflade til flere platforme for sekvenssammenligning og fylogeni
-
- rec: seer
- Genomisk sekvenselementberigelsesanalyse (kmer)
-
- rec: segemehl
- Kort læs-kortlægning med gaps
-
- rec: seqan-apps
- C++-bibliotek for analyse af biologiske sekvenser
-
- rec: seqan-needle
- Forhåndsfilter for optælling af meget store samlinger af nukleotidsekvenser
-
- rec: seqan-raptor
- Præfilter til at forespørge meget store samlinger af nukleotidsekvenser
-
- rec: seqkit
- Ultrahurtig værktøjssæt for flere platforme til FASTA/Q-filmanipulering
-
- rec: seqmagick
- Imagemagick-lignende brugerflade til Biopython SeqIO
-
- rec: seqprep
- Strippe adaptere og/eller sammenføjede parrede læsninger af DNA-sekvenser med overlap
-
- rec: seqsero
- Salmonella serotyping fra genomsekvensdata
-
- rec: seqtk
- Hurtigt letvægtsværktøj til behandling af sekvenser i formaterne FASTA eller FASTQ
-
- rec: sga
- De novo-genomsamler som bruger strenggrafer
-
- rec: shasta
- Nanopore-helgenomsamling - binære filer og skripter
-
- rec: shovill
- Saml bakterie isolat-genomer fra Illumina paired-end-læsninger
-
- rec: sibelia
- Komparativ genomisk værktøj
-
- rec: sibsim4
- Sammenlign udtrykte RNA-sekvenser på en DNA-skabelon
-
- rec: sickle
- Vinduesopdelt adaptiv trimmingværktøj for FASTQ-filer der bruger kvalitet
-
- rec: sigma-align
- Simpel grådig flerjustering af ikke-kodende DNA-sekvenser
-
- rec: sim4
- Værktøj for justering af cDNA og genomisk DNA
-
- rec: sim4db
- Jobopdelt sammenligning af cDNA-sekvenser til et målgenom
-
- rec: simka
- Komparativ metagenomikmetode dedikeret til NGS-datasæt
-
- rec: simkamin
- Omtrentlig komparativ metagenomikmetode dedikeret til NGS-datasæt
-
- rec: ska
- Split Kmer-analyse
-
- rec: skesa
- Strategisk Kmer-udvidelse for scrupulous-samlinger
-
- rec: skewer
- Efterbehandling af høj-gennemløb DNA-sekvenslæsninger
-
- rec: smalt
- Værktøj til sekvensoversættelse og sammenligning
-
- rec: smithwaterman
- Bestem lignende regioner mellem to strenge eller genomsekvenser
-
- rec: smrtanalysis
- Programpakke for enkel molekyle, realtids sekventering
-
- rec: snap
- Placering af gener fra DNA-sekvens med skjult Markovmodel
-
- rec: snap-aligner
- Scalable Nucleotide Alignment Program
-
- rec: sniffles
- Strukturel variationskalder der bruger tredjegenerations sekventering
-
- rec: snp-sites
- Binær kode for pakken snp-sites
-
- rec: snpeff
- Genetisk variantannotation og effektforudsigelsesværktøjskasse - værktøj
-
- rec: snpomatic
- Hurtig, stringent kort-læsning oversættelsesprogram
-
- rec: snpsift
- Værktøj til at annotere og manipulere genomvarianter - værktøj
-
- rec: soapaligner
- Sammenligning af korte læsninger for næste generations sekvensere
-
- rec: soapdenovo
- Short-read samlingsmetode til at bygge de novo-kladdesamling
-
- rec: soapdenovo2
- Short-read samlingsmetode til at bygge de novo-kladdesamling
-
- rec: soapsnp
- Resekvensredskab der kan samle genomkonsensussekvenser
-
- rec: sortmerna
- Værktøj til at filtrere, oversætte og OTU-udvælge NGS-læsninger
-
- rec: spaced
- Justeringsfri sekvenssammenligning ved hjælp af afskårne ord
-
- rec: spades
- Genomsamler for single-celle- og isolates-datasæt
-
- rec: spaln
- Opdelingsparat transkript-sammenligning til genomisk DNA
-
- rec: spoa
- SIMD-sammenligningsværktøj for partial order
-
- rec: sprai
- Forbedring af single-pass-sekventeringslæsenøjagtighed
-
- rec: spread-phy
- Analyser og visualiser fylogeografiske rekonstruktioner
-
- rec: squizz
- Konverteringsprogram for gentiske sekvenser og justeringer
-
- rec: sra-toolkit
- Redskaber for NCBI Sequence Read Archive
-
- rec: srst2
- Kort læsesekvensindtastning for bakterielle patogener
-
- rec: ssake
- Genomprogram for samling af millioner af meget korte DNA-sekvenser
-
- rec: sspace
- Scaffolding på forhånd samlede contig'er efter filendelse
-
- rec: ssw-align
- Smith-Waterman-justeringsprogram baseret på libssw
-
- rec: stacks
- Datakanal for bygning af loci fra kort-læs DNA-sekvenser
-
- rec: staden
- DNA-sekvenssamling (Gap4/Gap5), redigerings- og analyseværktøjer
-
- rec: staden-io-lib-utils
- Programmer til at manipulerer DNS-sekvensfiler
-
- rec: stringtie
- Saml korte RNAseq-læsninger til transkripter
-
- rec: subread
- Værktøjssæt til at behandle næstegen. sekvensdata
-
- rec: suitename
- Kategoriser hver programpakke i en RNA-backbone
-
- rec: sumaclust
- Hurtig og præcis klyngeopsætning af genomsekvenser
-
- rec: sumatra
- Hurtig og præcis sammenligning og sekvensklynger
-
- rec: sumtrees
- Fylogenetisk træsummering og annotation
-
- rec: surankco
- Overvåget rangering af Contigs i de novo-samlinger
-
- rec: surpyvor
- Ændring af VCF-filer med SURVIVOR
-
- rec: survivor
- Værktøjssæt for simulering/evaluering af SV'er
-
- rec: svim
- Strukturel variantkalder for lange sekventeringslæsninger
-
- rec: swarm
- Robust og hurtig klyngemetode for amplicon-baserede studier
-
- rec: sweed
- Vurdering af SNP'er for deres evolutionære fordele
-
- rec: t-coffee
- Flersekvensjustering
-
- rec: tabix
- Generisk indeksprogram for TAB-afgrænsede arvemassepositionsfiler
-
- rec: tantan
- Lav kompleksitet og tandem-gentagelsesmasker for biosekvenser
-
- rec: terraphast
- Tæl terrasser op i fylogentiske trærum
-
- rec: theseus
- Overlejring af makromolekyler med brug af maksimal sandsynlighed
-
- rec: thesias
- Test af haplotypeeffekter i associationsstudier
-
- rec: tiddit
- Strukturel variant-kald
-
- rec: tigr-glimmer
- Gen-detektion i arkæer og bakterier
-
- rec: tm-align
- Strukturel sammenligning af proteiner
-
- rec: tnseq-transit
- Statistiske beregninger af væsentlighed for gener eller genomregioner
-
- rec: toil
- Arbejdsgangsmotor for flere platforme
-
- rec: tombo
- Identifikation af ændrede nukleotider fra rå nanoporesekventeringsdata
-
- rec: tophat-recondition
- Efterbrænder for TopHat-uoversatte læsninger
-
- rec: topp
- Sæt af programmer der implementerer OpenMS Proteomic Pipeline
-
- rec: toppred
- Forudsigelse af transmembrantopologi
-
- rec: tortoize
- Program til at beregne ramachandran z-bedømmelser
-
- rec: trace2dbest
- Saml indsendelse af chromatogramdata til dbEST
-
- rec: tracetuner
- Fortolkning af DNA Sanger-sekventeringsdata
-
- rec: transdecoder
- Find kodningsregioner i RNA-transkriptsekvenser
-
- rec: transrate-tools
- Hjælpeprogram til transrate
-
- rec: transtermhp
- Find rho-uafhængige transkriptionsterminatorer i bakterielle genomer
-
- rec: tree-puzzle
- Rekonstruktion af fylogenetiske træer gennem maksimal lighed
- or tree-ppuzzle
- Paralleliseret rekonstruktion af fylogenetiske træer gennem maksimal lighed
-
- rec: treeview
- Ny Javaimplementering af Michael Eisens TreeView
-
- rec: treeviewx
- Viser og udskriver fylogenetiske træer
-
- rec: trf
- Find og vis tandem-gentagelser i DNA-sekvenser
-
- rec: trim-galore
- Automatiser kvalitet og adaptertilpasning for DNA-sekventering
-
- rec: trimmomatic
- Fleksibelt værktøj til læsetrimning af Illumina NGS-data
-
- rec: tvc
- Genetisk variantkalder for Ion Torrent-sekventeringsplatforme
-
- rec: twopaco
- Byg den kompakte de Bruijn-graf fra mange fuldstændige genomer
-
- rec: uc-echo
- Fejlkorrektionsalgoritme designet for kort-læsninger fra NGS
-
- rec: umap-learn
- Uniform Manifold Approximation and Projection
-
- rec: umis
- Værktøjer til at behandle UMI RNA-mærkedata
-
- rec: uncalled
- Redskab for Nanopore Current Alignment to Large Expanses of DNA
-
- rec: unicycler
- Hybrid samlingsdatakanal for bakterigenomer
-
- rec: unikmer
- Værktøjssæt for nukleinsyre k-mer-analyse
-
- rec: varna
- Visualiseringspanelprogram for RNA
-
- rec: vcfanno
- Kommenter en VCF med andre VCF'er/BED'er/tabixed-filer
-
- rec: vcftools
- Samling af værktøjer til arbejdet med VCF-filer
-
- rec: velvet
- Sekvens-assembler for nukleinsyre til meget korte læsninger
- or velvet-long
- Sekvens-assembler for nukleinsyre til meget korte læsninger - lang version
-
- rec: velvetoptimiser
- Optimer automatisk Velvet do novo-samlingsparametre
-
- rec: virulencefinder
- Identificer virulensgener i total eller delvis sekventerede isolater af bakterier
-
- rec: vmatch
- Program til sekvensanalyse i stor skala
-
- rec: vsearch
- Værktøj til behandling af metagenomiske sekvenser
-
- rec: vt
- Værktøjssæt for kort variant-registrering i genetiske sekvensdata
-
- rec: wham-align
- Wisconsin's High-Throughput Alignment Method
-
- rec: wigeon
- Ny implementering af Pintail 16S-detektionsredskabet for DNA-anamolier
-
- rec: wise
- Sammenligning af bioplymerer, såsom DNA- og protein-sekvenser
-
- rec: xpore
- Nanopore-analyse af differential RNA-ændringer
-
- rec: yaha
- Find split-read-oversættelser på single-end-forespørgsler
-
- rec: yanagiba
- Filtrer Oxford Nanopore-læsninger i lav kvalitet basecalled med Albacore
-
- rec: yanosim
- Læs simulator nanopore DRS-datasæt
-
- sug: acacia
- Package not available
-
- sug: adun.app
- Molekylær simulator for GNUstep - grafisk brugerflade
-
- sug: agat
- Package not available
-
- sug: amos-assembler
- Package not available
-
- sug: amoscmp
- Package not available
-
- sug: anfo
- Short Read Aligner/Mapper fra MPG
-
- sug: annovar
- Package not available
-
- sug: apollo
- Package not available
-
- sug: arachne
- Package not available
-
- sug: arb
- phylogenetic sequence analysis suite - main program
-
- sug: arvados
- Package not available
-
- sug: asap
- Package not available
-
- sug: axparafit
- Package not available
-
- sug: axpcoords
- Package not available
-
- sug: bagpipe
- Package not available
-
- sug: bambus
- Package not available
-
- sug: bax2bam
- Package not available
-
- sug: bcbio
- toolkit for analysing high-throughput sequencing data
-
- sug: biceps
- Package not available
-
- sug: big-blast
- Package not available
-
- sug: bigsdb
- Package not available
-
- sug: bismark
- Package not available
-
- sug: blat
- Package not available
-
- sug: blimps-utils
- blocks database improved searcher
-
- sug: blobology
- Package not available
-
- sug: braker
- Package not available
-
- sug: btk-core
- Package not available
-
- sug: cactus
- Package not available
-
- sug: caftools
- Package not available
-
- sug: card-rgi
- Package not available
-
- sug: catfishq
- Sammenkobler fastq-filer
-
- sug: cdna-db
- Package not available
-
- sug: cellprofiler
- Package not available
-
- sug: cinema
- Package not available
-
- sug: cluster3
- Reimplementation of the Eisen-clustering software
-
- sug: cmap
- Package not available
-
- sug: conda-package-handling
- Opret og udtræk conda-pakker i diverse formater
-
- sug: condetri
- Package not available
-
- sug: contrafold
- Package not available
-
- sug: contralign
- Package not available
-
- sug: coot
- Modelbygningsprogram for makromolekylær krystallografi
-
- sug: copycat
- Package not available
-
- sug: covpipe
- Package not available
-
- sug: crossbow
- Package not available
-
- sug: crux-toolkit
- Package not available
-
- sug: cufflinks
- Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq
-
- sug: cytoscape
- Package not available
-
- sug: dascrubber
- Sammenligningsbaseret scrubbing-datakanal for DNA-sekvenslæsninger
-
- sug: dazzle
- Package not available
-
- sug: deepbinner
- Package not available
-
- sug: deepnano
- Package not available
-
- sug: dendroscope
- Package not available
-
- sug: diann
- Package not available
-
- sug: dnapi
- Adapterforudsigelse for lille RNA-sekventering - værktøjer
-
- sug: e-hive
- Package not available
-
- sug: ecell
- Package not available
-
- sug: embassy-phylip
- Package not available
-
- sug: emboss-explorer
- Netbaseret grafisk brugerflade for EMBOSS
-
- sug: ensembl
- Package not available
-
- sug: ensembl-vep
- Package not available
-
- sug: epigrass
- videnskabeligt værktøj for simulationer og scenarieanalyse i netværksepidemilogi
-
- sug: estferret
- Package not available
-
- sug: euler-sr
- Package not available
-
- sug: euler2
- Package not available
-
- sug: exabayes
- Package not available
-
- sug: exalt
- Package not available
-
- sug: excavator
- Package not available
-
- sug: ffp
- Package not available
-
- sug: fieldbioinformatics
- Package not available
-
- sug: figaro
- Package not available
-
- sug: flappie
- Package not available
-
- sug: forester
- Package not available
-
- sug: forge
- Package not available
-
- sug: galaxy
- Package not available
-
- sug: gatk
- Package not available
-
- sug: gbrowse-syn
- Package not available
-
- sug: genemark
- Package not available
-
- sug: genesplicer
- Package not available
-
- sug: genetrack
- Package not available
-
- sug: genezilla
- Package not available
-
- sug: genographer
- Package not available
-
- sug: gerp++
- Package not available
-
- sug: getdata
- Håndtering af eksterne databaser
-
- sug: glimmerhmm
- Package not available
-
- sug: gmv
- Package not available
-
- sug: gramalign
- Package not available
-
- sug: graphbin
- Package not available
-
- sug: graphmap2
- Package not available
-
- sug: haploview
- Package not available
-
- sug: hawkeye
- Package not available
-
- sug: htqc
- Package not available
-
- sug: hts-nim-tools
- Værktøjer til biologiske sekvenser: bam-filter, count-reads, vcf-check
-
- sug: idefix
- Package not available
-
- sug: idseq-bench
- Sammenligningsprogram for IDseq Portal
-
- sug: igdiscover
- Analyserer antistof-arkiver for at finde nye V-gener
-
- sug: illustrate
- Tegneserieagtig repræsentationer af store biologiske molekyler
-
- sug: inspect
- Package not available
-
- sug: jbrowse
- Package not available
-
- sug: jigsaw
- Package not available
-
- sug: kempbasu
- Package not available
-
- sug: libhdf5-dev
- HDF5 - udviklingsfiler - seriel version
-
- sug: libhnswlib-dev
- fast approximate nearest neighbor search
-
- sug: lofreq
- Package not available
-
- sug: mach-haplotyper
- Package not available
-
- sug: mage2tab
- Package not available
-
- sug: maker2
- Package not available
-
- sug: manta
- Package not available
-
- sug: marginphase
- Package not available
-
- sug: martj
- Package not available
-
- sug: maude
- Højtydende logisk ramme
-
- sug: maxd
- Package not available
-
- sug: medaka
- Package not available
-
- sug: meme
- Package not available
-
- sug: mesquite
- Package not available
-
- sug: metabit
- Package not available
-
- sug: metaeuk
- sensitive, high-throughput gene discovery and annotation for metagenomics
-
- sug: metarep
- Package not available
-
- sug: metastudent-data
- Indikator for genontologivilkår fra proteinsekvens - datafiler
-
- sug: metastudent-data-2
- Indikator for genontologivilkår fra proteinsekvens - data #2
-
- sug: migrate
- Package not available
-
- sug: minimus
- Package not available
-
- sug: mirbase
- Package not available
-
- sug: modeller
- Package not available
-
- sug: molekel
- Package not available
-
- sug: mosaik-aligner
- Package not available
-
- sug: mpsqed
- Package not available
-
- sug: mrs
- Package not available
-
- sug: msatfinder
- Package not available
-
- sug: mugsy
- Package not available
-
- sug: mummergpu
- Package not available
-
- sug: mview
- Package not available
-
- sug: nano-snakemake
- Package not available
-
- sug: nanocall
- Package not available
-
- sug: nanocomp
- Package not available
-
- sug: nanoplot
- Package not available
-
- sug: ncbi-magicblast
- Package not available
-
- sug: nextsv
- Package not available
-
- sug: ngila
- Package not available
-
- sug: ngsqctoolkit
- Package not available
-
- sug: nw-align
- Package not available
-
- sug: oases
- Package not available
-
- sug: obo-edit
- Package not available
-
- sug: oligoarrayaux
- Package not available
-
- sug: omegamap
- Package not available
-
- sug: oncofuse
- Package not available
-
- sug: operondb
- Package not available
-
- sug: optitype
- Package not available
-
- sug: paipline
- Package not available
-
- sug: pangolin
- Package not available
-
- sug: partigene
- Package not available
-
- sug: partitionfinder
- Package not available
-
- sug: patristic
- Package not available
-
- sug: pcma
- Package not available
-
- sug: pfaat
- Package not available
-
- sug: phagefinder
- Package not available
-
- sug: phpphylotree
- Package not available
-
- sug: phylographer
- Package not available
-
- sug: phylophlan
- Package not available
-
- sug: phyloviz-core
- Package not available
-
- sug: phylowin
- Package not available
-
- sug: pigx-scrnaseq
- Package not available
-
- sug: pipasic
- Package not available
-
- sug: plato
- Package not available
-
- sug: pomoxis
- Package not available
-
- sug: pplacer
- phylogenetic placement and downstream analysis
-
- sug: profit
- Package not available
-
- sug: profphd
- Package not available
-
- sug: prot4est
- Package not available
-
- sug: psipred
- Package not available
-
- sug: pssh2
- Package not available
-
- sug: pufferfish
- Package not available
-
- sug: purple
- Package not available
-
- sug: pyrophosphate-tools
- Package not available
-
- sug: python3-alignlib
- Edit- og Hamming-afstande for biologiske sekvenser
-
- sug: python3-anndata
- Kommenteret gen efter numpy-matrix
-
- sug: python3-cgecore
- Python 3-modul for Center for Genomic Epidemiology
-
- sug: python3-cyvcf2
- VCF-fortolker baseret på htslib - Python 3
-
- sug: python3-deeptools
- Platform til at udforske biologiske deep-sequencing-data
-
- sug: python3-deeptoolsintervals
- Håndtering af GTF-lignende sekvensassocieret interal-annotation
-
- sug: python3-htseq
- Python 3-redskaber til høj-gennemløb læseanalyse af genomsekventeringer
-
- sug: python3-intake
- Simpel pakke til at finde og undersøge data
-
- sug: python3-loompy
- Tilgå Loom-formaterede filer for bioinformatik
-
- sug: python3-nanoget
- Udtræk information fra Oxford Nanopore-sekventeringsdata og sammenligninger
-
- sug: python3-nanomath
- simple math function for other Oxford Nanopore processing scripts
-
- sug: python3-ncls
- Datastruktur for forespørgsler for intervaloverlap
-
- sug: python3-orange
- Package not available
-
- sug: python3-py2bit
- Adgang til 2bit-filer
-
- sug: python3-pybel
- Biologisk udtrykssprog
-
- sug: python3-pychopper
- Identificer, orienter og trim fuldlængde Nanopore cDNS-læsninger
-
- sug: python3-pyfaidx
- Effektiv vilkårlig adgang til fasta-undersekvenser for Python 3
-
- sug: python3-pyflow
- Simpel parallel opgavemotor for Python
-
- sug: python3-pyranges
- 2D-repræsentation af genom-intervaller og deres annotationer
-
- sug: python3-pyrle
- Afvikl længdearitmetik i Python
-
- sug: python3-pysam
- Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3
-
- sug: python3-tinyalign
- Numerisk repræsentation af forskelle mellem strenge
-
- sug: q2-alignment
- QIIME 2-udvidelsesmodul for oprettelse og manipulation af sammenligninger
-
- sug: q2-composition
- Package not available
-
- sug: q2-cutadapt
- QIIME 2-udvidelsesmodul til arbejdet med adaptere i sekvensdata
-
- sug: q2-dada2
- QIIME 2-udvidelsesmodul for arbejdet med adaptere i sekvensdata
-
- sug: q2-deblur
- Package not available
-
- sug: q2-demux
- QIIME 2-udvidelsesmodul for demultiplexing af sekvenslæsninger
-
- sug: q2-diversity
- Package not available
-
- sug: q2-emperor
- QIIME2-udvidelsesmodul til at vise ordinationsplot
-
- sug: q2-feature-classifier
- QIIME 2-udvidelsesmodul der understøtter taksonomisk klassifikation
-
- sug: q2-feature-table
- QIIME 2-udvidelsesmodul der understøtter operationer på funktionstabeller
-
- sug: q2-fragment-insertion
- QIIME2-udvidelsesmodul til fragmentindsættelse
-
- sug: q2-gneiss
- Package not available
-
- sug: q2-longitudinal
- Package not available
-
- sug: q2-metadata
- QIIME 2-udvidelsesmodul for arbejdet med og visualisering af metadata
-
- sug: q2-phylogeny
- QIIME 2-udvidelsesmodul for phylogeny
-
- sug: q2-quality-control
- QIIME 2-udvidelsesmodul for kvalitetssikkerhed i funktions- og sekvensdata
-
- sug: q2-quality-filter
- QIIME 2-udvidelsesmodul for PHRED-baseret filtrering og tilpasning
-
- sug: q2-sample-classifier
- QIIME 2-udvidelsesmodul for maskinlæringsforudsigelse fra data
-
- sug: q2-taxa
- QIIME 2-udvidelsesmodul for arbejdet med funktionstaksonomiannotationer
-
- sug: q2-types
- QIIME 2-udvidelsesmodul der definerer typer for mikrobiom analyse
-
- sug: q2-vsearch
- Package not available
-
- sug: q2cli
- Klikbaseret kommandolinjegrænseflade for QIIME 2
-
- sug: q2templates
- Designskabelonpakke for QIIME 2-udvidelsesmoduler
-
- sug: qtlcart
- Package not available
-
- sug: qtlreaper
- Package not available
-
- sug: qualimap
- Package not available
-
- sug: quast
- Package not available
-
- sug: r-bioc-annotationhub
- GNU R-klient til at tilgå AnnotationHub-ressourcer
-
- sug: r-bioc-aroma.light
- BioConductor-metoder - normalisering og visualisering af microarray-data
-
- sug: r-bioc-beachmat
- I/O for several formats storing matrix data
-
- sug: r-bioc-biocneighbors
- Nearest Neighbor Detection for Bioconductor-pakker
-
- sug: r-bioc-biocsingular
- Singular Value Decomposition for Bioconductor Packages
-
- sug: r-bioc-bitseq
- Package not available
-
- sug: r-bioc-ctc
- Klynge- og trækonvertering
-
- sug: r-bioc-dnacopy
- R-pakke: dataanalyse af DNA-kopinummer
-
- sug: r-bioc-ensembldb
- GNU R-redskaber til at oprette og bruge en Ensembl-baseret annotationsdatabase
-
- sug: r-bioc-experimenthub
- BioConductor-klient til at tilgå ExperimentHub-ressourcer
-
- sug: r-bioc-geneplotter
- R-pakke med funktioner til plot af genomdata
-
- sug: r-bioc-genomicalignments
- Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger
-
- sug: r-bioc-genomicfiles
- Distribueret beregning efter fil eller efter interval
-
- sug: r-bioc-genomicranges
- BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller
-
- sug: r-bioc-go.db
- Annotationskort der beskriver hele genontologien
-
- sug: r-bioc-grohmm
- GRO-seq Analysis Pipeline
-
- sug: r-bioc-gviz
- Plot data og annotationsinformation langs genomiske koordinater
-
- sug: r-bioc-isoformswitchanalyzer
- Identify, Annotate and Visualize Alternative Splicing and
-
- sug: r-bioc-mofa2
- Package not available
-
- sug: r-bioc-org.hs.eg.db
- Genom-bred annotation for mennesker
-
- sug: r-bioc-org.mm.eg.db
- Package not available
-
- sug: r-bioc-qusage
- Qusage - kvantitativ sætanalyse til genekspression
-
- sug: r-bioc-savr
- GNU R - fortolk og analyser Illumina SAV-filer
-
- sug: r-bioc-singlecellexperiment
- S4 Classes for Single Cell Data
-
- sug: r-bioc-structuralvariantannotation
- Variantannotationer for strukturelle varianter
-
- sug: r-bioc-tximport
- Estimater på transkriptniveau for biologisk sekventering
-
- sug: r-cran-amap
- Endnu en flerdiminsionel analysepakke
-
- sug: r-cran-biwt
- Biweight middelvektor og kovarians og korrelation
-
- sug: r-cran-boolnet
- Samling, analyse og visualisering af booleske netværk
-
- sug: r-cran-corrplot
- Visualisering af en korrelationsmatrix
-
- sug: r-cran-drinsight
- Package not available
-
- sug: r-cran-dynamictreecut
- Metoder til registrering af klynger i Hierarchical Clustering
-
- sug: r-cran-epir
- GNU R-funktioner for analyse af epidemiologiske data
-
- sug: r-cran-fitdistrplus
- Understøtter tilpasning af parametrisk distribution
-
- sug: r-cran-forecast
- GNU R-prognosefunktioner for tidsserier og lineære modeller
-
- sug: r-cran-gprofiler2
- Interface to the 'g:Profiler' Toolset
-
- sug: r-cran-minerva
- Maximal Information-Based Nonparametric Exploration
-
- sug: r-cran-optimalcutpoints
- Beregning af optimale klippepunkter i diagnostiske test
-
- sug: r-cran-parmigene
- Parallel Mutual Information til at etablere gennetværk
-
- sug: r-cran-pheatmap
- GNU R-pakke til at oprette smukke varmekort
-
- sug: r-cran-qqman
- R-pakke til at visualisere GWAS-resultater via Q-Q- og Manhattan-plot
-
- sug: r-cran-rcpphnsw
- R-bindinger for et bibliotek for Approximate Nearest Neighbors
-
- sug: r-cran-rentrez
- GNU R-grænseflade til NCBI's EUtils API
-
- sug: r-cran-sctransform
- Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI-data
-
- sug: r-other-apmswapp
- Package not available
-
- sug: r-other-fastbaps
- Package not available
-
- sug: raccoon
- Package not available
-
- sug: raxml-ng
- Package not available
-
- sug: rbs-finder
- Package not available
-
- sug: relion-cuda
- parallel toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy
-
- sug: relion-gui-cuda
- toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy (gui apps)
-
- sug: repeatmasker
- Package not available
-
- sug: resfinder-db
- ResFinder-databasen er en kurateret database for erhvervede resistensgener
-
- sug: roadtrips
- Package not available
-
- sug: roche454ace2caf
- Package not available
-
- sug: rosa
- Package not available
-
- sug: rose
- Package not available
-
- sug: rsat
- Package not available
-
- sug: sailfish
- Package not available
-
- sug: sap
- Package not available
-
- sug: science-workflow
- Håndteringssystem til arbejdsforløb der er nyttig i videnskabelig forskning
-
- sug: sepp
- Fylogeni med ensembler af Hidden Markov-modeller
-
- sug: seq-gen
- simulate the evolution of nucleotide or amino acid sequences
-
- sug: seq-seq-pan
- Package not available
-
- sug: seqcluster
- analysis of small RNA in NGS data
-
- sug: seqwish
- Package not available
-
- sug: sift
- predicts if a substitution in a protein has a phenotypic effect
-
- sug: signalalign
- Package not available
-
- sug: sina
- Package not available
-
- sug: sistr
- Package not available
-
- sug: situs
- Package not available
-
- sug: snippy
- Hurtig haploid-variantkald og kernegenomjustering
-
- sug: solvate
- arranges water molecules around protein structures
-
- sug: sourmash
- Package not available
-
- sug: sparta
- Package not available
-
- sug: splitstree
- Package not available
-
- sug: ssaha
- Package not available
-
- sug: strap
- Package not available
-
- sug: strap-base
- Package not available
-
- sug: strelka
- Package not available
-
- sug: tab2mage
- Package not available
-
- sug: tacg
- Package not available
-
- sug: tandem-genotypes
- Package not available
-
- sug: taverna
- Package not available
-
- sug: taxinspector
- Package not available
-
- sug: tetra
- Package not available
-
- sug: tide
- Package not available
-
- sug: tigr-glimmer-mg
- Package not available
-
- sug: tipp
- Værktøj til taksonomisk identifikation og fylogenetisk profilering
-
- sug: tn-seqexplorer
- Package not available
-
- sug: tophat
- Package not available
-
- sug: treebuilder3d
- Package not available
-
- sug: trinityrnaseq
- RNA-Seq De novo Assembly
-
- sug: tripal
- Package not available
-
- sug: trnascan-se
- detection of transfer RNA genes in genomic sequence
-
- sug: twain
- Package not available
-
- sug: ufasta
- Package not available
-
- sug: ugene
- Integreret værktøjssæt for bioinformatik
-
- sug: umap
- Package not available
-
- sug: unc-fish
- Package not available
-
- sug: uniprime
- Package not available
-
- sug: varmatch
- Package not available
-
- sug: varscan
- variant detection in next-generation sequencing data
-
- sug: vdjtools
- framework for post-analysis of B/T cell repertoires
-
- sug: vg
- Værktøjer til arbejdet med genomvariationsgrafer
-
- sug: vienna-rna
- RNA sequence analysis
-
- sug: viewmol
- Package not available
-
- sug: vmd
- Package not available
-
- sug: x-tandem-pipeline
- Package not available
-
- sug: zodiac-zeden
- Package not available
Download med-bio
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 14.0 kB | 44.0 kB | [list of files] |