Package: concavity (0.1+dfsg.1-5) [debports]

[ Source:  ]

Forudsigelse af proteinligandbindingssteder fra struktur og bevaring

ConCavity forudser proteinligandbindingssteder ved at kombinere evolutionær sekvensbevaring og 3D-struktur.

ConCavity bruger en PDB-formateret proteinstruktur og ekstra filer, som karakteriserer bevarelsen af kæderne for den evolutionære sekvens i strukturfilen.

De følgende resultatfiler laves som standard:

 * Restligandbindende forudsigelser for hver kæde (*.scores).
 * Restligandbindende forudsigelser i en PDB-formatfil (restbedømmelser
   placeres i temp.-faktorfeltet, *_residue.pdb).
 * Pocket-forudsigelsesplaceringer i en DX-formatfil (*.dx).
 * PyMOL-skript til at visualisere forudsigelserne (*.pml).

Other Packages Related to concavity

• dep: libc6.1 (>= 2.31)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: libunwind8

  Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

• sug: conservation-code

  Værktøj til bedømmelse af bevaring af proteinsekvens

• sug: pymol

  System til molekylærgrafik

Download concavity

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
ia64 (unofficial port)	266.8 kB	1,406.0 kB	[list of files]