Package: fastml (3.11-4 and others)
Links for fastml
Debian Resources:
Download Source Package fastml:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [fastml.tau.ac.il]
Similar packages:
Maximum likelihood-nedarvet aminosyresekvensgenopbygning
FastML er et bioinformatikværktøj til genopbygning af nedarvede sekvenser baseret på de fylogenetiske relationer mellem homologe sekvenser. FastML driver flere algoritmer, der rekonstruerer de nedarvede sekvenser med vægt på en nøjagtig rekonstruktion af både indels og tegn. For tegnrekonstruktion anvendes den tidligere beskrevne FastML-algoritme til effektivt at udlede de mest sandsynlige nedarvede sekvenser for hver intern knude i træet. Både fælles og marginale rekonstruktioner leveres. For indels genopbygning er sekvenser først kodet i henhold til Indelhændelser detekteret inden i flere sekvensjusteringer (MSA) og derefter anvendes en moderne sandsynlighedsmodel til at rekonstruere nedarvede indels-tilstande. Resultaterne er de mest sandsynlige sekvenser sammen med posterior-sandsynlighederne for hvert tegn og indel ved hver sekvensposition for hver intern knude i træet. FastML er generisk og er gældende for enhver form for molekylære sekvenser (nucleotid-, protein- eller codon-sekvenser).
Other Packages Related to fastml
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, arm64, ia64, sh4]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, s390x, x32]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid
Download fastml
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 3.11-4 | 811.5 kB | 3,999.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 3.11-4 | 925.6 kB | 3,474.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 3.11-4+b1 | 806.9 kB | 3,355.0 kB | [list of files] |
| armel | 3.11-4 | 771.6 kB | 3,195.0 kB | [list of files] |
| armhf | 3.11-4 | 769.9 kB | 2,187.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 3.11-4 | 818.6 kB | 3,237.0 kB | [list of files] |
| i386 | 3.11-4 | 939.9 kB | 3,547.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 3.11-4 | 1,023.3 kB | 7,140.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 3.11-4 | 833.8 kB | 3,359.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 3.11-4 | 768.4 kB | 4,153.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 3.11-4 | 863.6 kB | 4,250.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 3.11-4 | 880.4 kB | 4,058.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 3.11-4 | 880.2 kB | 2,502.0 kB | [list of files] |
| s390x | 3.11-4 | 913.6 kB | 3,634.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 3.11-4 | 1,026.7 kB | 3,163.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 3.11-4 | 700.2 kB | 5,156.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 3.11-4 | 931.8 kB | 3,327.0 kB | [list of files] |