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[ Quellcode: r-bioc-dnacopy  ]

Paket: r-bioc-dnacopy (1.80.0-1)

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Ähnliche Pakete:

Experimentelles Paket

Warnung: Dieses Paket stammt aus der Experimental-Distribution. Dies bedeutet, dass es höchstwahrscheinlich instabil oder fehlerhaft ist und sogar Datenverlust verursachen kann. Bitte lesen Sie den Changelog und andere möglicherweise verfügbare Dokumentation, bevor Sie es benutzen.

R package: DNA copy number data analysis

Implements the circular binary segmentation (CBS) algorithm to segment DNA copy number data and identify genomic regions with abnormal copy number.

This package is for analyzing array DNA copy number data, which is usually (but not always) called array Comparative Genomic Hybridization (array CGH) data It implements a methodology for finding change-points in these data which are points after which the (log) test over reference ratios have changed location. This model is that the change-points correspond to positions where the underlying DNA copy number has changed. Therefore, change-points can be used to identify regions of gained and lost copy number. Also provided is a function for making relevant plots of these data.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-dnacopy

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ppc64 (inoffizielle Portierung) 489,8 kB622,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 488,6 kB621,0 kB [Liste der Dateien]
riscv64 486,8 kB593,0 kB [Liste der Dateien]
s390x 489,1 kB605,0 kB [Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung) 483,9 kB1.582,0 kB [Liste der Dateien]