Package: hinge (0.5.0-4)

[ Source: hinge  ]

Assembler til læsning af lange genomer baseret på hinging

HINGE er en genomassembler, som forsøger at opnå optimal gentagelsesopslag ved at skelne gentagelser, som kan slås op givet dataene fra disse som ikke kan. Dette opnås ved at tilføje »hinges« til læsninger for at konstruere en graf med overlap hvor kun gentagelser, der ikke kunne slås op, sammenføjes. Som resultat kombinerer HINGE fejltolerancen for overlap-baserede assemblere med gentag-opslags funktioner for de Bruijn-grafassemblere.

Other Packages Related to hinge

• dep: daligner

  Lokal tilpasningsregistrering mellem lange nukleotidsekventeringslæsninger

• dep: dascrubber

  Sammenligningsbaseret scrubbing-datakanal for DNA-sekvenslæsninger

• dep: dazzdb

  Håndter data for nukleotidsekventeringslæsning

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc1 (>= 1:4.5) [arm64]

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python

  Interaktivt objektorienteret sprog på højt niveau - Python 2-version

• dep: python-colormap

  ease manipulation of matplotlib colormaps and color codecs (Python 2)

• dep: python-configparser

  Tilbageportering af den forbedrede konfiguratonsfortolker introduceret i Python 3.2

• dep: python-matplotlib

  Pythonbaseret plotsystem i en stil der ligner Matlab

• dep: python-networkx

  Værktøj til at oprette, manipulere og studere komplekse netværk

• dep: python-numpy

  Numerisk Python tilføjer en hurtig vektor-/array-facilitet til Pythonsproget

• dep: python-pbcore

  Python 2-bibliotek for behandling af PacBio-datafiler

• dep: python-ujson

  Ultra hurtig JSON-koder og afkoder for Python 2

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download hinge

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	421.7 kB	2,790.0 kB	[list of files]
arm64	384.3 kB	2,646.0 kB	[list of files]