Package: python3-cyvcf2 (0.10.4-1)

[ Source: cyvcf2  ]

VCF-fortolker baseret på htslib - Python 3

Dette modul tillader hurtig fortolkning af VCF og BCF inklusive regionsforespørgsler med Python. Dette er essentielt for effektiv analyse af nukleotid variation med Python på sekventeringsdata med høj-gennemløb.

Cyvcf2 er et cython-omslag omkring htslib. Attributter som variant.gt_ref_depths returnerer en numpy-tabel direkte, så de er direkte klar til brug.

Denne pakke installerer biblioteket for Python 3.

Other Packages Related to python3-cyvcf2

• dep: libbz2-1.0

  højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2)

  Simpelt adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden - GnuTLS-variant

• dep: libhts2 (>= 1.2.1)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)

  Kompressionsbibliotek for XZ-formatet

• dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

  Secure Sockets Layer-værktøjssæt - delte biblioteker

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af python3

  dep: python3 (<< 3.8)

  dep: python3 (>= 3.7~)

• dep: python3-numpy

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• sug: python-cyvcf2-doc

  Package not available

Download python3-cyvcf2

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armhf	757.4 kB	4,315.0 kB	[list of files]