Paquet : python3-cyvcf2 (0.10.4-1)

[ Paquet source : cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Autres paquets associés à python3-cyvcf2

• dep: libbz2-1.0

  Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)

• dep: libc6 (>= 2.7)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2)

  bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS

• dep: libhts2 (>= 1.2.1)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)

  librairie de compression au format XZ

• dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

  trousse à outils SSL - bibliothèques partagées

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.8)

  dep: python3 (>= 3.7~)

• dep: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

• sug: python-cyvcf2-doc

  Paquet indisponible

Télécharger python3-cyvcf2

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
armhf	757,4 ko	4 315,0 ko	[liste des fichiers]