Пакунок: python3-cyvcf2 (0.10.4-1)

[ Source: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Інші пакунки пов'язані з python3-cyvcf2

• dep: libbz2-1.0

  Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль

• dep: libc6 (>= 2.7)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2)

  Легка у використанні клієнтська бібліотека передачі URL (різновид GnuTLS)

• dep: libhts2 (>= 1.2.1)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)

  Бібліотека стиснення даних у формат XZ

• dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

  Інструментарій Secure Sockets Layer (рівень захищених сокетів)  — колективні бібліотеки

• dep: python3

  Інтерактивна об'єктно-орієнтована мова високого рівня (типова версія „python3“)

  dep: python3 (<< 3.8)

  dep: python3 (>= 3.7~)

• dep: python3-numpy

  Швидкі методи для роботи з числовими масивами для мови Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

• sug: python-cyvcf2-doc

  Пакунок недоступний

Завантажити python3-cyvcf2

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
armhf	757.4 kB	4,315.0 kB	[список файлів]