Package: bcbio (1.1.2-3)

[ Source: bcbio  ]

Værktøjssæt til at analysere sekvensdata med høj gennemløb

Denne pakke installerer værktøjerne for kommandolinjen for værktøjssættet bcbio-nextgen, der implementerer datakanaler på bedste vis for fuld automatiseret sekvensanalyse med høj gennemløb.

En konfigurationsfil på højt niveau angiver inddata- og analyseparametre til at drive en parallel datakanal, der håndterer distribueret kørsel, idempotent behandling genstarter og sikre transaktionstrin. Projektet bidrager med en delt fællesskabsressource, der håndterer databehandlingskomponenten for sekvensanalyse, der giver forskere mere tid til at fokusere på nedstrømsbiologien.

Other Packages Related to bcbio

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af python3

• dep: python3-bcbio

  library for analysing high-throughput sequencing data

• sug: bcbio-doc

  Dokumentation for RNAseq-arbejdsforløb for bcbio (-nextgen)

• sug: cwltool

  Common Workflow Language - referenceimplementering

• sug: toil

  Arbejdsgangsmotor for flere platforme

Download bcbio

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	126.1 kB	185.0 kB	[list of files]