Pakiet: bcbio (1.1.2-3)

[ Pakiet źródłowy: bcbio  ]

toolkit for analysing high-throughput sequencing data

This package installs the command line tools of the bcbio-nextgen toolkit implementing best-practice pipelines for fully automated high throughput sequencing analysis.

A high-level configuration file specifies inputs and analysis parameters to drive a parallel pipeline that handles distributed execution, idempotent processing restarts and safe transactional steps. The project contributes a shared community resource that handles the data processing component of sequencing analysis, providing researchers with more time to focus on the downstream biology.

Inne pakiety związane z bcbio

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: python3-bcbio

  library for analysing high-throughput sequencing data

• sug: bcbio-doc

  Documentation for RNAseq-workflows of bcbio(-nextgen)

• sug: cwltool

  Common Workflow Language reference implementation

• sug: toil

  Wieloplatformowy silnik przepływu pracy

Pobieranie bcbio

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	126,1 KiB	185,0 KiB	[lista plików]