Package: skesa (2.4.0-1)

[ Source: skesa  ]

Strategisk Kmer-udvidelse for scrupulous-samlinger

SKESA er en DeBruijn-grafbaseret de-novo-samler designet for samling af læsninger af mikrobiologiske genomsekvenser via Illuminia. Sammenligning med SPAdes og MegaHit viser, at SKESA udarbejder samlinger, der har høj sekvenskvalitet og sammenhæng, håndterer forurening på lavt niveau i læsninger, er hurtig og producerer en identisk samling med de samme data, når den samles flere gange med den samme eller forskellige beregnede ressourcer. SKESA er blevet brugt til samling af over 272.000 læste sæt i Sequence Read Archive hos NCBI og til realtids patogen registrering.

Other Packages Related to skesa

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libncbi-vdb2 (>= 2.10.6+dfsg)

  libraries for using data in the INSDC Sequence Read Archives

• dep: libstdc++6 (>= 7)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download skesa

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	688.1 kB	2,662.0 kB	[list of files]
i386	745.7 kB	3,100.0 kB	[list of files]