软件包：skewer（0.2.2-6 以及其他的）

[ 源代码： skewer  ]

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

其他与 skewer 有关的软件包

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [除 armel, armhf, i386, mipsel]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU 标准 C++ 库，第3版

下载 skewer

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
amd64	0.2.2-6+b1	86.4 kB	216.0 kB	[文件列表]
arm64	0.2.2-6+b1	76.4 kB	235.0 kB	[文件列表]
armel	0.2.2-6+b1	75.2 kB	235.0 kB	[文件列表]
armhf	0.2.2-6+b1	75.5 kB	171.0 kB	[文件列表]
i386	0.2.2-6+b1	90.2 kB	231.0 kB	[文件列表]
mips64el	0.2.2-6+b1	81.5 kB	242.0 kB	[文件列表]
mipsel	0.2.2-6+b1	83.1 kB	240.0 kB	[文件列表]
ppc64el	0.2.2-6+b1	84.9 kB	236.0 kB	[文件列表]
s390x	0.2.2-6+b1	76.0 kB	199.0 kB	[文件列表]