[ Source: quicktree ]
Package: quicktree (2.5-5)
Links for quicktree
Debian Resources:
Download Source Package quicktree:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Neighbor-Joining-algoritme for fylogenier
Quicktree er en effektiv implementering af Neighbor-Joining-algoritmen (PMID: 3447015), der kan rekonstruere fylogenier fra store sammenligninger i tid mindre end universets alder.
QuickTree accepterer både afstandsmatrix og data fra multiple-sequence-alignment. Den første skal være i PHYLIP-format. Den sidste skal være i Stockholm-format, der er standardformet for sammenligning for Pfam-databasen. Sammenligninger i forskellige formater kan konverteres til Stockholm-formatet via programmet sreformat, der er en del af pakken HMMer (hmmer.org).
Tress skrives til standardud, i Newick/New-Hampshire-formatet brugt af PHYLIP og mange andre programmer.
Other Packages Related to quicktree
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
Download quicktree
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 20.5 kB | 56.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 19.2 kB | 56.0 kB | [list of files] |
| armel | 19.8 kB | 56.0 kB | [list of files] |
| armhf | 17.5 kB | 44.0 kB | [list of files] |
| i386 | 21.3 kB | 60.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 21.1 kB | 64.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 20.9 kB | 62.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 23.3 kB | 85.0 kB | [list of files] |
| s390x | 19.7 kB | 60.0 kB | [list of files] |