all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: libfastahack  ]

Package: fastahack (1.0.0+dfsg-10)

Links for fastahack

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package libfastahack:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Redskab for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer

Fastahack er et lille program til indeksering og udtrækning af sekvenser og undersekvenser fra FASTA-filer. Det inkluderede Fasta.cpp-bibliotek tilbyder en FASTA-læser og et indeksprogram, som kan indlejres i programmer, som vil have nytte af direkte læsning af undersekvenser fra FASTA-filer. Biblioteket håndterer automatisk oprettelse af indeksfil og brug.

Funktioner:

 * FASTA-indeksoprettelse (.fai) for FASTA-filer
 * Sekvensudtrækning
 * Undersekvensudtrækning
 * Sekvensstatistik (i øjeblikket er kun entropi indeholdt)

Sekvens- og undersekvensudtrækning bruger fseek64 til at tilbyde hurtigst mulig udtrækning uden RAM-intensive operationer for filindlæsning. Dette gør fastahack til et nyttigt værktøj for bioinformatikere, som hurtigt skal udtrække mange undersekvenser fra en FASTA-referencesekvens.

Other Packages Related to fastahack

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download fastahack

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
i386 12.7 kB43.0 kB [list of files]