Пакет: python3-pairix (0.3.8-1 и други)

Връзки за python3-pairix

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник python-pairix.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

1D/2D indexing and querying with a pair of genomic coordinates

Pairix is a tool for indexing and querying on a block-compressed text file containing pairs of genomic coordinates.

Pairix is a stand-alone C program that was written on top of tabix as a tool for the 4DN-standard pairs file format describing Hi-C data: pairs_format_specification.md

However, Pairix can be used as a generic tool for indexing and querying any bgzipped text file containing genomic coordinates, for either 2D- or 1D- indexing and querying.

For example: given the custom text file below, you want to extract specific lines from the Pairs file further below. An awk command would read the Pairs file from beginning to end. Pairix creates an index and uses it to access the file from a relevant position by taking advantage of bgzf compression, allowing for a fast query on large files.

Други пакети, свързани с python3-pairix

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: python3 (<< 3.10) [hppa]

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

dep: python3 (<< 3.14) [не hppa, ia64]

dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

dep: python3 (>= 3.13~) [не hppa, ia64]

dep: python3 (>= 3.9~) [hppa]

Изтегляне на python3-pairix

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	0.3.8-1+b2	41,1 кБ	157,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	0.3.8-1+b2	41,6 кБ	120,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	0.3.8-1+b2	38,9 кБ	156,0 кБ	[списък на файловете]
armel	0.3.8-1+b2	37,1 кБ	155,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	0.3.8-1+b2	36,1 кБ	91,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	0.3.7-4	40,6 кБ	120,0 кБ	[списък на файловете]
i386	0.3.8-1+b2	45,5 кБ	127,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	0.3.7-7	54,3 кБ	353,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	0.3.8-1+b2	35,8 кБ	107,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	0.3.8-1+b2	39,1 кБ	163,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	0.3.8-1+b2	47,2 кБ	156,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	0.3.8-1+b2	42,1 кБ	108,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	0.3.8-1+b2	45,5 кБ	155,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	0.3.8-1+b2	41,7 кБ	115,0 кБ	[списък на файловете]