Пакет: zalign (0.9.1-5)

[ Източник: zalign  ]

parallel local alignment of biological sequences

zAlign is a local sequence aligner, especially intended for use with large biological DNA sequences, with more than 1Mbp (Millions of base pairs). It uses the Smith-Waterman exact algorithm with affine gap cost function to perform this task.

zAlign can be used both in distributed (clusters, for example) or standalone environments. Currently it has been tested on Linux and Sun Solaris, using both the MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) and OpenMPI (http://www.open-mpi.org/) implementations. Ports for other Unix-like environments are highly considered.

Други пакети, свързани с zalign

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [не amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 4.9)

  GNU Standard C++ Library v3

Изтегляне на zalign

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	47,9 кБ	267,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	45,1 кБ	263,0 кБ	[списък на файловете]
armel	25,4 кБ	117,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	25,6 кБ	97,0 кБ	[списък на файловете]
i386	48,4 кБ	261,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	50,3 кБ	550,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	48,9 кБ	318,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	50,7 кБ	415,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	46,5 кБ	287,0 кБ	[списък на файловете]