Пакет: kma (1.3.10-1)

[ Източник: kma  ]

mapping genomic sequences to raw reads directly against redundant databases

KMA is mapping a method designed to map raw reads directly against redundant databases, in an ultra-fast manner using seed and extend. KMA is particularly good at aligning high quality reads against highly redundant databases, where unique matches often does not exist. It works for long low quality reads as well, such as those from Nanopore. Non- unique matches are resolved using the "ConClave" sorting scheme, and a consensus sequence are outputtet in addition to other common attributes.

Други пакети, свързани с kma

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

Изтегляне на kma

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	179,4 кБ	487,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	168,7 кБ	487,0 кБ	[списък на файловете]
armel	123,1 кБ	344,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	124,2 кБ	240,0 кБ	[списък на файловете]
i386	143,9 кБ	404,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	174,6 кБ	586,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	126,3 кБ	380,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	195,7 кБ	731,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	169,0 кБ	535,0 кБ	[списък на файловете]