Pakiet: kma (1.3.10-1)

[ Pakiet źródłowy: kma  ]

mapping genomic sequences to raw reads directly against redundant databases

KMA is mapping a method designed to map raw reads directly against redundant databases, in an ultra-fast manner using seed and extend. KMA is particularly good at aligning high quality reads against highly redundant databases, where unique matches often does not exist. It works for long low quality reads as well, such as those from Nanopore. Non- unique matches are resolved using the "ConClave" sorting scheme, and a consensus sequence are outputtet in addition to other common attributes.

Inne pakiety związane z kma

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie kma

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	179,4 KiB	487,0 KiB	[lista plików]
arm64	168,7 KiB	487,0 KiB	[lista plików]
armel	123,1 KiB	344,0 KiB	[lista plików]
armhf	124,2 KiB	240,0 KiB	[lista plików]
i386	143,9 KiB	404,0 KiB	[lista plików]
mips64el	174,6 KiB	586,0 KiB	[lista plików]
mipsel	126,3 KiB	380,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	195,7 KiB	731,0 KiB	[lista plików]
s390x	169,0 KiB	535,0 KiB	[lista plików]