Pacote: kma (1.3.10-1)

[ Fonte: kma  ]

mapping genomic sequences to raw reads directly against redundant databases

KMA is mapping a method designed to map raw reads directly against redundant databases, in an ultra-fast manner using seed and extend. KMA is particularly good at aligning high quality reads against highly redundant databases, where unique matches often does not exist. It works for long low quality reads as well, such as those from Nanopore. Non- unique matches are resolved using the "ConClave" sorting scheme, and a consensus sequence are outputtet in addition to other common attributes.

Outros pacotes relacionados a kma

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de kma

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	179.4 kB	487.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	168.7 kB	487.0 kB	[lista de arquivos]
armel	123.1 kB	344.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	124.2 kB	240.0 kB	[lista de arquivos]
i386	143.9 kB	404.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	174.6 kB	586.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	126.3 kB	380.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	195.7 kB	731.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	169.0 kB	535.0 kB	[lista de arquivos]