Пакет: fastqtl (2.184+dfsg-7 и други)

[ Източник: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, User Interface: interface::commandline, role::program, Purpose: Analysing

Други пакети, свързани с fastqtl

• dep: libblas3

  Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

  или libblas.so.3

  виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Boost.Iostreams Library

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgsl25 (>= 2.6)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [не mipsel]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [mipsel]

• dep: r-mathlib

  GNU R standalone mathematics library

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Изтегляне на fastqtl

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	2.184+dfsg-7+b4	195,7 кБ	669,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2.184+dfsg-7+b4	172,3 кБ	617,0 кБ	[списък на файловете]
armel	2.184+dfsg-7+b4	161,1 кБ	576,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	2.184+dfsg-7+b4	164,0 кБ	436,0 кБ	[списък на файловете]
i386	2.184+dfsg-7+b4	200,3 кБ	676,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2.184+dfsg-7+b4	169,6 кБ	752,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	2.184+dfsg-7+b4	171,3 кБ	731,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2.184+dfsg-7+b4	197,6 кБ	761,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	2.184+dfsg-7+b4	166,8 кБ	657,0 кБ	[списък на файловете]