Pakiet: fastqtl (2.184+dfsg-7 i inne)

[ Pakiet źródłowy: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Interfejs użytkownika: interface::commandline, role::program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z fastqtl

• dep: libblas3

  Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

  lub libblas.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Biblioteka Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgsl25 (>= 2.6)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [nie mipsel]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [mipsel]

• dep: r-mathlib

  GNU R standalone mathematics library

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Pobieranie fastqtl

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2.184+dfsg-7+b4	195,7 KiB	669,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.184+dfsg-7+b4	172,3 KiB	617,0 KiB	[lista plików]
armel	2.184+dfsg-7+b4	161,1 KiB	576,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.184+dfsg-7+b4	164,0 KiB	436,0 KiB	[lista plików]
i386	2.184+dfsg-7+b4	200,3 KiB	676,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.184+dfsg-7+b4	169,6 KiB	752,0 KiB	[lista plików]
mipsel	2.184+dfsg-7+b4	171,3 KiB	731,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.184+dfsg-7+b4	197,6 KiB	761,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.184+dfsg-7+b4	166,8 KiB	657,0 KiB	[lista plików]