套件：ngmlr（0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2 以及其他的）

ngmlr 的相關連結

Debian 的資源：

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維護小組：

外部的資源：

主頁 [github.com]

相似套件：

CoNvex Gap-cost alignMents for Long Reads

Ngmlr is a long-read mapper designed to sensitively align PacBilo or Oxford Nanopore to (large) reference genomes. It was designed to quickly and correctly align the reads, including those spanning (complex) structural variations. Ngmlr uses an SV aware k-mer search to find approximate mapping locations for a read and then a banded Smith- Waterman alignment algorithm to compute the final alignment. Ngmlr uses a convex gap cost model that penalizes gap extensions for longer gaps less than for shorter ones to compute precise alignments.

其他與 ngmlr 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libc6 (>= 2.29) [m68k, ppc64, sparc64, x32]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x]

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC 支援函式庫

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 支援函式庫
dep: libssw0 (>= 1.1)

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
dep: libstdc++6 (>= 11) [除 arm64, riscv64]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

下載 ngmlr

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2	671。9 kB	1，238。0 kB	[檔案列表]
amd64	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	673。7 kB	1，157。0 kB	[檔案列表]
arm64	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b2	655。1 kB	1，173。0 kB	[檔案列表]
armel	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	648。7 kB	1，172。0 kB	[檔案列表]
armhf	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	649。2 kB	1，044。0 kB	[檔案列表]
i386	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	680。7 kB	1，184。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2	715。8 kB	1，608。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2	661。5 kB	1，171。0 kB	[檔案列表]
mips64el	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	657。3 kB	1，260。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2	673。7 kB	1，300。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	677。5 kB	1，301。0 kB	[檔案列表]
riscv64	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	669。3 kB	1，077。0 kB	[檔案列表]
s390x	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	655。1 kB	1，173。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2	693。8 kB	1，132。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2	648。4 kB	1，168。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2	669。3 kB	1，127。0 kB	[檔案列表]