套件：hts-nim-tools（0.2.1-1 以及其他的）

hts-nim-tools 的相關連結

Debian 的資源：

下載原始碼套件 hts-nim-tools：

維護小組：

外部的資源：

主頁 [github.com]

相似套件：

tools biological sequences: bam-filter, count-reads, vcf-check

This package provides several tools that (at least at the time of their creation) provide functionalities beyond the routine provided by samtools and other reverse dependencies of the htslib.

These new tools are

 • bam-filter : filter BAM/CRAM/SAM files with a simple expression language
 • count-reads: count BAM/CRAM reads in regions given in a BED file
 • vcf-check  : check regions of a VCF against a background for missing chunks

and yes, as the name suggests, these tools are all implemented in nim, using the nim-hts (upstream: hts-nim) wrapper for the htslib.

其他與 hts-nim-tools 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libc6 (>= 2.29) [除 riscv64]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
dep: nim-hts-dev

wrapper for hts C library

下載 hts-nim-tools

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
amd64	0.2.1-1	198。0 kB	864。0 kB	[檔案列表]
arm64	0.2.1-1	164。6 kB	844。0 kB	[檔案列表]
armel	0.2.1-1	182。9 kB	832。0 kB	[檔案列表]
armhf	0.2.1-1	182。9 kB	604。0 kB	[檔案列表]
i386	0.2.1-1	186。0 kB	843。0 kB	[檔案列表]
mips64el	0.2.1-1	137。8 kB	951。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.2.1-1	155。9 kB	981。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	0.2.1-1	158。6 kB	916。0 kB	[檔案列表]
riscv64	0.2.1-1+b1	158。8 kB	573。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.2.1-1	135。8 kB	944。0 kB	[檔案列表]