Пакет: hts-nim-tools (0.2.1-2 и другие)

[ Источник: hts-nim-tools  ]

tools biological sequences: bam-filter, count-reads, vcf-check

This package provides several tools that (at least at the time of their creation) provide functionalities beyond the routine provided by samtools and other reverse dependencies of the htslib.

These new tools are

 • bam-filter : filter BAM/CRAM/SAM files with a simple expression language
 • count-reads: count BAM/CRAM reads in regions given in a BED file
 • vcf-check  : check regions of a VCF against a background for missing chunks

and yes, as the name suggests, these tools are all implemented in nim, using the nim-hts (upstream: hts-nim) wrapper for the htslib.

Другие пакеты, относящиеся к hts-nim-tools

• dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [не sparc64]

• dep: nim-hts-dev

  wrapper for hts C library

Загрузка hts-nim-tools

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	0.2.1-2	162,5 Кб	704,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.2.1-2	139,6 Кб	724,0 Кб	[список файлов]
armel	0.2.1-2	145,4 Кб	644,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.2.1-2	145,1 Кб	480,0 Кб	[список файлов]
i386	0.2.1-2	166,3 Кб	703,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.2.1-2	128,8 Кб	816,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.2.1-2	141,2 Кб	853,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.2.1-2	143,1 Кб	788,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.2.1-2	158,6 Кб	572,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.2.1-1	135,8 Кб	944,0 Кб	[список файлов]