套件：gsort（0.1.4-3 以及其他的）

[ 原始碼： gsort  ]

sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

其他與 gsort 有關的套件

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ppc64, x32]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

• dep: libgo22 [alpha, ppc64, sparc64, x32]

  Runtime library for GNU Go applications

下載 gsort

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	0.1.4-3+b9	168。2 kB	806。0 kB	[檔案列表]
amd64	0.1.4-3+b19	2，140。3 kB	6，313。0 kB	[檔案列表]
arm64	0.1.4-3+b19	1，844。4 kB	5，989。0 kB	[檔案列表]
armel	0.1.4-3+b19	1，825。3 kB	6，204。0 kB	[檔案列表]
armhf	0.1.4-3+b19	1，815。6 kB	6，076。0 kB	[檔案列表]
i386	0.1.4-3+b19	1，989。5 kB	6，140。0 kB	[檔案列表]
mips64el	0.1.4-3+b19	1，656。4 kB	6，840。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.1.4-3+b10	195。7 kB	1，123。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	0.1.4-3+b19	1，836。5 kB	6，180。0 kB	[檔案列表]
riscv64 （非官方移植版）	0.1.4-3+b9	1，551。6 kB	5，008。0 kB	[檔案列表]
s390x	0.1.4-3+b19	1，950。1 kB	6，629。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.1.4-3+b8	165。5 kB	1，257。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	0.1.4-3+b10	175。1 kB	703。0 kB	[檔案列表]