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套件:python3-pairtools(1.0.2-2 以及其他的)

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相似套件:

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

其他與 python3-pairtools 有關的套件

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硬體架構 版本 套件大小 安裝後大小 檔案
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arm64 1.0.2-2+b1 147。9 kB702。0 kB [檔案列表]
armel 1.0.2-2+b1 144。8 kB622。0 kB [檔案列表]
armhf 1.0.2-2+b1 144。9 kB554。0 kB [檔案列表]
i386 1.0.2-2+b1 160。8 kB674。0 kB [檔案列表]
mips64el 1.0.2-2+b1 146。4 kB776。0 kB [檔案列表]
mipsel 1.0.2-2+b1 144。8 kB702。0 kB [檔案列表]
ppc64el 1.0.2-2+b1 158。4 kB766。0 kB [檔案列表]