[ Source: megadepth ]
Пакунок: megadepth (1.2.0-4 and others)
Links for megadepth
Debian Resources:
Download Source Package megadepth:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
computes coverage from BigWig and BAM sequencing files
A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.
This package is a successor of the program 'bamcount'.
Інші пакунки пов'язані з megadepth
|
|
|
|
-
- dep: libbigwig0t64 (>= 0.4.6)
- C library for handling bigWig files
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- sug: r-bioc-megadepth
- BioCOnductor BigWig and BAM related utilities
Завантажити megadepth
Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
---|---|---|---|---|
s390x | 1.2.0-4+b1 | 82.1 kB | 271.0 kB | [список файлів] |