all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: libseqlib  ]

Пакунок: libseqlib-dev (1.2.0+dfsg-11 and others)

Links for libseqlib-dev

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package libseqlib:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data (dev)

C++ API and command line tool that provides a rapid and user-friendly interface to BAM/SAM/CRAM files, global sequence alignment operations and sequence assembly. Four C libraries perform core operations in SeqLib: HTSlib for BAM access, BWA-MEM and BLAT for sequence alignment and Fermi for error correction and sequence assembly. Benchmarking indicates that SeqLib has lower CPU and memory requirements than leading C++ sequence analysis APIs. Minimal SeqLib code can extract, error-correct and assemble reads from a CRAM file and then align with BWA-MEM. SeqLib also provides additional capabilities, including chromosome-aware interval queries and read plotting. Command line tools are available for performing integrated error correction, micro-assemblies and alignment.

This package contains the header files and static library.

Tags: Software Development: Бібліотеки, Role: Development Library

Інші пакунки пов'язані з libseqlib-dev

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Завантажити libseqlib-dev

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Версія Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
amd64 1.2.0+dfsg-11+b2 216.1 kB1,186.0 kB [список файлів]
arm64 1.2.0+dfsg-11+b2 203.5 kB1,191.0 kB [список файлів]
armel 1.2.0+dfsg-11+b2 204.5 kB1,077.0 kB [список файлів]
armhf 1.2.0+dfsg-11+b2 206.3 kB970.0 kB [список файлів]
i386 1.2.0+dfsg-11+b2 230.5 kB1,017.0 kB [список файлів]
mips64el 1.2.0+dfsg-11+b2 223.9 kB1,393.0 kB [список файлів]
ppc64el 1.2.0+dfsg-11+b2 224.6 kB1,273.0 kB [список файлів]
riscv64 1.2.0+dfsg-11+b2 676.7 kB6,552.0 kB [список файлів]
s390x 1.2.0+dfsg-11+b2 210.7 kB1,180.0 kB [список файлів]