Пакет: libseqlib-dev (1.2.0+dfsg-11 и други)

Връзки за libseqlib-dev

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник libseqlib.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data (dev)

C++ API and command line tool that provides a rapid and user-friendly interface to BAM/SAM/CRAM files, global sequence alignment operations and sequence assembly. Four C libraries perform core operations in SeqLib: HTSlib for BAM access, BWA-MEM and BLAT for sequence alignment and Fermi for error correction and sequence assembly. Benchmarking indicates that SeqLib has lower CPU and memory requirements than leading C++ sequence analysis APIs. Minimal SeqLib code can extract, error-correct and assemble reads from a CRAM file and then align with BWA-MEM. SeqLib also provides additional capabilities, including chromosome-aware interval queries and read plotting. Command line tools are available for performing integrated error correction, micro-assemblies and alignment.

This package contains the header files and static library.

Етикети: Software Development: Библиотеки, Role: Development Library

Други пакети, свързани с libseqlib-dev

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libbwa-dev

Burrows-Wheeler Aligner source files
dep: libfml-dev

development headers for libfml
dep: libhts-dev

development files for the HTSlib
dep: libjsoncpp-dev

library for reading and writing JSON for C++ (devel files)
dep: libseqlib2 (= 1.2.0+dfsg-11+b2)

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data
dep: libssw-dev

Development headers and static libraries for libssw
също и виртуален пакет, предлаган от libssw-dev
dep: zlib1g-dev

compression library - development

Изтегляне на libseqlib-dev

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1.2.0+dfsg-11+b2	216,1 кБ	1 186,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.2.0+dfsg-11+b2	203,5 кБ	1 191,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.2.0+dfsg-11+b2	204,5 кБ	1 077,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.2.0+dfsg-11+b2	206,3 кБ	970,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.2.0+dfsg-11+b2	230,5 кБ	1 017,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.2.0+dfsg-11+b2	223,9 кБ	1 393,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.2.0+dfsg-11+b2	224,6 кБ	1 273,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.2.0+dfsg-11+b2	676,7 кБ	6 552,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.2.0+dfsg-11+b2	210,7 кБ	1 180,0 кБ	[списък на файловете]