Пакунок: vt (0.57721+ds-3 and others) [debports]

[ Source:  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Інші пакунки пов'язані з vt

• dep: libbz2-1.0

  Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2)

  Легка у використанні клієнтська бібліотека передачі URL (різновид GnuTLS)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)

  Бібліотека стиснення даних у формат XZ

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  New Perl Compatible Regular Expression Library- 8 bit runtime files

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)

  Інструментарій Secure Sockets Layer (рівень захищених сокетів)  — колективні бібліотеки

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: libsvm3 (>= 3.21+ds)

  library implementing support vector machines

• dep: r-base-core

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-mathlib (>= 4.3.3)

  GNU R standalone mathematics library

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити vt

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
sparc64 (unofficial port)	0.57721+ds-3+b2	597.0 kB	3,097.0 kB	[список файлів]