Paket: vt (0.57721+ds-3 und andere) [debports]

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toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Andere Pakete mit Bezug zu vt

• dep: libbz2-1.0

  Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2)

  Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)

  Bibliothek für das XZ-Kompressionsformat

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  Neue »Perl Compatible Regular Expression Library« - 8-Bit-Laufzeitdateien

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)

  Werkzeugsatz für das Secure Socket Layer (SSL) - Laufzeitbibliotheken

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libsvm3 (>= 3.21+ds)

  Bibliothek zur Implementierung von Support Vector Machines

• dep: r-base-core

  GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern

• dep: r-mathlib (>= 4.3.3)

  Eigenständige Mathematikbibliothek für GNU R

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.57721+ds-3+b2	597,0 kB	3.097,0 kB	[Liste der Dateien]