Balík: vt (0.57721+ds-3 a iné) [debports]

[ Zdroj:  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom vt

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2)

  jednoducho použiteľná klientská knižnica na prenos URL - verzia GnuTLS

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  podporná knižnica GCC

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)

  komprimačná knižnica formátu XZ

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  nová knižnica PCRE - 8-bitová dynamická knižnica

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)

  sada nástrojov SSL (Secure Sockets Layer) - zdieľné knižnice

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: libsvm3 (>= 3.21+ds)

  library implementing support vector machines

• dep: r-base-core

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-mathlib (>= 4.3.3)

  GNU R standalone mathematics library

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť vt

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
sparc64 (neoficiálny port)	0.57721+ds-3+b2	597.0 kB	3,097.0 kB	[zoznam súborov]