Пакунок: r-bioc-rsamtools (2.18.0+dfsg-1 and others) [debports]

[ Source:  ]

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

This package provides an interface to the 'samtools', 'bcftools', and 'tabix' utilities for manipulating SAM (Sequence Alignment / Map), binary variant call (BCF) and compressed indexed tab-delimited (tabix) files.

Інші пакунки пов'язані з r-bioc-rsamtools

• dep: libbz2-1.0

  Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libcurl4 (>= 7.18.0)

  Легка у використанні клієнтська бібліотека передачі URL (різновид OpenSSL)

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Бібліотека стиснення даних у формат XZ

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: libunwind8

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18

  Пакунок недоступний

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.3)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.99.3)

  HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)

  BioConductor representation and manpulation of external sequences

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-bitops

  GNU R package implementing bitwise operations

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-genomicalignments

  BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-shortread (>= 1.19.10)

  GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

Завантажити r-bioc-rsamtools

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
ia64 (unofficial port)	2.18.0+dfsg-1+b1	3,636.0 kB	6,843.0 kB	[список файлів]