all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: pairtools  ]

Пакунок: python3-pairtools (1.0.3-1 and others)

Links for python3-pairtools

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package pairtools:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

Інші пакунки пов'язані з python3-pairtools

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Завантажити python3-pairtools

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Версія Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
i386 1.0.3-1+b2 193.8 kB797.0 kB [список файлів]