Пакунок: meryl (0~20150903+r2013-6)

[ Source: kmer  ]

in- and out-of-core kmer counting and utilities

meryl computes the kmer content of genomic sequences. Kmer content is represented as a list of kmers and the number of times each occurs in the input sequences. The kmer can be restricted to only the forward kmer, only the reverse kmer, or the canonical kmer (lexicographically smaller of the forward and reverse kmer at each location). Meryl can report the histogram of counts, the list of kmers and their counts, or can perform mathematical and set operations on the processed data files.

This package is part of the Kmer suite.

Інші пакунки пов'язані з meryl

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• sug: gridengine-client

  Utilities for Grid Engine queue management

Завантажити meryl

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	193.8 kB	1,471.0 kB	[список файлів]
arm64	190.2 kB	1,319.0 kB	[список файлів]
armhf	215.7 kB	1,339.0 kB	[список файлів]
i386	235.0 kB	1,867.0 kB	[список файлів]