Paket: meryl (0~20150903+r2013-6)

[ Quellcode: kmer  ]

in- and out-of-core kmer counting and utilities

meryl computes the kmer content of genomic sequences. Kmer content is represented as a list of kmers and the number of times each occurs in the input sequences. The kmer can be restricted to only the forward kmer, only the reverse kmer, or the canonical kmer (lexicographically smaller of the forward and reverse kmer at each location). Meryl can report the histogram of counts, the list of kmers and their counts, or can perform mathematical and set operations on the processed data files.

This package is part of the Kmer suite.

Andere Pakete mit Bezug zu meryl

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• sug: gridengine-client

  Programme zur Verwaltung der »Grid Engine«-Warteschlangen

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	193,8 kB	1.471,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	190,2 kB	1.319,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	215,7 kB	1.339,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	235,0 kB	1.867,0 kB	[Liste der Dateien]