Пакунок: proteinortho (6.1.7+dfsg-1)
Links for proteinortho
Debian Resources:
Download Source Package proteinortho:
- [proteinortho_6.1.7+dfsg-1.dsc]
- [proteinortho_6.1.7+dfsg.orig.tar.xz]
- [proteinortho_6.1.7+dfsg-1.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [gitlab.com]
Similar packages:
Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis
Proteinortho is a stand-alone tool that is geared towards large datasets and makes use of distributed computing techniques when run on multi-core hardware. It implements an extended version of the reciprocal best alignment heuristic. Proteinortho was applied to compute orthologous proteins in the complete set of all 717 eubacterial genomes available at NCBI at the beginning of 2009. Authors succeeded identifying thirty proteins present in 99% of all bacterial proteomes.
Інші пакунки пов'язані з proteinortho
|
|
|
|
-
- dep: diamond-aligner (>= 2.0.10~)
- accelerated BLAST compatible local sequence aligner
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: liblapack3
- Бібліотека підпрограм лінійної алгебри вер. 3 — колективна версія
-
- dep: libstdc++6 (>= 12)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- dep: ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
-
- dep: perl
- Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
-
- dep: procps
- Утиліти файлової системи /proc
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
Завантажити proteinortho
Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
---|---|---|---|
amd64 | 259.0 kB | 971.0 kB | [список файлів] |
arm64 | 249.4 kB | 1,035.0 kB | [список файлів] |
ppc64el | 267.5 kB | 1,099.0 kB | [список файлів] |
s390x | 247.9 kB | 967.0 kB | [список файлів] |