Paket: r-bioc-titancna (1.42.0-1 ve diğerleri)

[ Kaynak: r-bioc-titancna  ]

Subclonal copy number and LOH prediction from whole genome sequencing

Hidden Markov model to segment and predict regions of subclonal copy number alterations (CNA) and loss of heterozygosity (LOH), and estimate cellular prevalence of clonal clusters in tumour whole genome sequencing data.

r-bioc-titancna ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa, mips64el, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.3) [ppc64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: r-api-4.0

  sanal paketi sağlayan r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

  Paket mevcut değil

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

  Paket mevcut değil

• dep: r-api-bioc-3.19 [hppa, ia64, sh4, x32 değil]

  sanal paketi sağlayan r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.31.6) [hppa, ia64, sh4, x32]

  generic functions for Bioconductor

  dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0) [hppa, ia64, sh4, x32 değil]

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1) [hppa, ia64, sh4, x32 değil]

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

  dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.8.7) [hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.24.3) [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

  dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1) [hppa, ia64, sh4, x32 değil]

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1) [hppa, ia64, sh4, x32 değil]

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

  dep: r-bioc-iranges (>= 2.6.1) [hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.18.7) [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor annotation of genetic variants

  dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.50.0) [hppa, ia64, sh4, x32 değil]

• dep: r-cran-data.table (>= 1.10.4)

  GNU R extension of Data.frame

• dep: r-cran-dplyr (>= 0.5.0)

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-foreach (>= 1.4.3)

  GNU R foreach looping support

r-bioc-titancna indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	1.42.0-1	3.818,3 kB	7.666,0 kB	[dosya listesi]
amd64	1.42.0-1	3.819,3 kB	7.622,0 kB	[dosya listesi]
arm64	1.42.0-1	3.819,8 kB	7.666,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	1.40.0-1	3.814,8 kB	7.619,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	1.40.0-1	3.815,7 kB	7.626,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	1.42.0-1	3.818,0 kB	7.667,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	1.42.0-1	3.819,2 kB	7.666,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	1.42.0-1	3.818,4 kB	7.666,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	1.42.0-1	3.817,4 kB	7.614,0 kB	[dosya listesi]
s390x	1.42.0-1	3.820,3 kB	7.622,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	1.40.0-1	3.814,2 kB	7.662,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	1.36.0-1	3.810,1 kB	7.608,0 kB	[dosya listesi]