Balík: r-bioc-titancna (1.42.0-1 a iné)

[ Zdroj: r-bioc-titancna  ]

Subclonal copy number and LOH prediction from whole genome sequencing

Hidden Markov model to segment and predict regions of subclonal copy number alterations (CNA) and loss of heterozygosity (LOH), and estimate cellular prevalence of clonal clusters in tumour whole genome sequencing data.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-titancna

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa, mips64el, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.3) [ppc64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: r-api-4.0

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

  Balík nie je dostupný

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

  Balík nie je dostupný

• dep: r-api-bioc-3.19 [nie hppa, ia64, sh4, x32]

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.31.6) [hppa, ia64, sh4, x32]

  generic functions for Bioconductor

  dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

  dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.8.7) [hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.24.3) [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

  dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

  dep: r-bioc-iranges (>= 2.6.1) [hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.18.7) [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor annotation of genetic variants

  dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.50.0) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-cran-data.table (>= 1.10.4)

  GNU R - rozšírenie Data.frame

• dep: r-cran-dplyr (>= 0.5.0)

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-foreach (>= 1.4.3)

  GNU R podpora cyklov foreach

Stiahnuť r-bioc-titancna

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.42.0-1	3,818.3 kB	7,666.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.42.0-1	3,819.3 kB	7,622.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.42.0-1	3,819.8 kB	7,666.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.40.0-1	3,814.8 kB	7,619.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.40.0-1	3,815.7 kB	7,626.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.42.0-1	3,818.0 kB	7,667.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.42.0-1	3,819.2 kB	7,666.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.42.0-1	3,818.4 kB	7,666.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.42.0-1	3,817.4 kB	7,614.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.42.0-1	3,820.3 kB	7,622.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.40.0-1	3,814.2 kB	7,662.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.36.0-1	3,810.1 kB	7,608.0 kB	[zoznam súborov]