Paket: python3-pairtools-examples (1.1.3-1 ve diğerleri)

[ Kaynak: pairtools  ]

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

python3-pairtools-examples ile İlgili Diğer Paketler

• enh: python3-pairtools

  Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

python3-pairtools-examples indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	1.1.3-1	942,9 kB	997,0 kB	[dosya listesi]
amd64	1.1.3-1	942,9 kB	997,0 kB	[dosya listesi]
arm64	1.1.3-1	942,9 kB	997,0 kB	[dosya listesi]
armel	1.1.2-1	942,4 kB	997,0 kB	[dosya listesi]
armhf	1.1.2-1	942,4 kB	997,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	0.3.0-3.2+b2	12,1 kB	50,0 kB	[dosya listesi]
i386	1.1.2-1	942,4 kB	997,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	0.3.0-3.2+b1	12,1 kB	50,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	1.1.2-1	942,4 kB	997,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	1.1.3-1	942,9 kB	997,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	0.3.0-3.2+b2	12,1 kB	50,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	1.1.3-1	942,9 kB	997,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	1.1.3-1	942,9 kB	997,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	1.1.2-1	942,4 kB	997,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	0.3.0-3.2+b2	12,1 kB	50,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	0.3.0-3.2+b1	12,1 kB	50,0 kB	[dosya listesi]