alla flaggor
[  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Källkod: pairtools  ]

Paket: python3-pairtools-examples (1.1.2-1 och andra)

Länkar för python3-pairtools-examples

Screenshot

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet pairtools:

Ansvariga:

Externa resurser:

Liknande paket:

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations: 

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

Andra paket besläktade med python3-pairtools-examples

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • enhances

Hämta python3-pairtools-examples

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Version Paketstorlek Installerad storlek Filer
alpha (inofficiell anpassning) 1.0.3-1+b1 790,3 kbyte844,0 kbyte [filförteckning]
amd64 1.1.2-1 942,4 kbyte997,0 kbyte [filförteckning]
arm64 1.1.2-1 942,4 kbyte997,0 kbyte [filförteckning]
armel 1.1.2-1 942,4 kbyte997,0 kbyte [filförteckning]
armhf 1.1.2-1 942,4 kbyte997,0 kbyte [filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning) 0.3.0-3.2+b2 12,1 kbyte50,0 kbyte [filförteckning]
i386 1.1.2-1 942,4 kbyte997,0 kbyte [filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning) 0.3.0-3.2+b1 12,1 kbyte50,0 kbyte [filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning) 1.1.2-1 942,4 kbyte997,0 kbyte [filförteckning]
mips64el 1.1.2-1 942,4 kbyte997,0 kbyte [filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning) 0.3.0-3.2+b2 12,1 kbyte50,0 kbyte [filförteckning]
ppc64el 1.1.2-1 942,4 kbyte997,0 kbyte [filförteckning]
riscv64 1.1.2-1 942,4 kbyte997,0 kbyte [filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning) 1.1.2-1 942,4 kbyte997,0 kbyte [filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning) 0.3.0-3.2+b2 12,1 kbyte50,0 kbyte [filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning) 0.3.0-3.2+b1 12,1 kbyte50,0 kbyte [filförteckning]