Paket: samtools (1.21-0+exp1)

[ Kaynak: samtools  ]

Deneysel paket

Uyarı: Bu paket deneysel dağıtımdan geliyor. Bu, paketin kararsız veya hatalı olabileceği hatta veri kaybına sebep olabileceği anlamına gelmektedir. Lütfen kullanmadan önce değişim günlüğüne ve muhtemel diğer belgelendirmeye danıştığınızdan emin olun.

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Etiketler: Alan: Biyoloji, Biyoinformatik, Geliştirildiği dil: implemented-in::c, interface::commandline, Ağ: İstemci, Ağ Protokolü: FTP, protocol::http, role::program, Kapsam: Yardımcı Araç, Arayüz Araç Takımı: Ncurses TUI, Amaç: use::analysing, use::calculating, Filtreleme, Şununla çalışır: Biyolojik Dizi

samtools ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.21)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libncurses6 (>= 6)

  shared libraries for terminal handling

• dep: libtinfo6 (>= 6)

  shared low-level terminfo library for terminal handling

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  compression library - runtime

• sug: cwltool

  Common Workflow Language reference implementation

samtools indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
i386	683,2 kB	1.572,0 kB	[dosya listesi]