Paket: srst2 (0.1.8-1) [debports]

Länkar för srst2

Debianresurser:

Felrapporter

Hämta källkodspaketet :

Hittades ej

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [katholt.github.io]

Liknande paket:

Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens

This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.

Andra paket besläktade med srst2

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: bowtie2

ultrafast memory-efficient short read aligner
dep: cd-hit

suite of programs designed to quickly group sequences
dep: python

Paketet inte tillgängligt
dep: python-biopython

Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)
dep: python-scipy

Paketet inte tillgängligt
dep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Hämta srst2

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
x32 (inofficiell anpassning)	58,6 kbyte	258,0 kbyte	[filförteckning]