Paket: bali-phy (3.5.0.1+dfsg-1) [debports]

[ Källkod:  ]

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

Andra paket besläktade med bali-phy

• dep: libboost-chrono1.71.0

  Paketet inte tillgängligt

• dep: libboost-filesystem1.71.0

  Paketet inte tillgängligt

• dep: libboost-program-options1.71.0

  Paketet inte tillgängligt

• dep: libboost-random1.71.0

  Paketet inte tillgängligt

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

  Cairo 2D vector graphics library

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC stödbibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• rec: gnuplot

  Command-line driven interactive plotting program.
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• rec: r-base

  GNU R statistical computation and graphics system

• sug: figtree

  graphical phylogenetic tree viewer

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

Hämta bali-phy

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
x32 (inofficiell anpassning)	5.788,7 kbyte	33.442,0 kbyte	[filförteckning]