Paketti: bali-phy (3.5.0.1+dfsg-1) [debports]

[ Source:  ]

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

Muut pakettiin bali-phy liittyvät paketit

• dep: libboost-chrono1.71.0

  Paketti ei saatavilla

• dep: libboost-filesystem1.71.0

  Paketti ei saatavilla

• dep: libboost-program-options1.71.0

  Paketti ei saatavilla

• dep: libboost-random1.71.0

  Paketti ei saatavilla

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

  Cairo 2D vector graphics library

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: perl

  Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• rec: gnuplot

  Command-line driven interactive plotting program.
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• rec: r-base

  GNU R statistical computation and graphics system

• sug: figtree

  graphical phylogenetic tree viewer

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

Imuroi bali-phy

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
x32 (epävirallinen siirros)	5,788.7 kt	33,442.0 kt	[tiedostoluettelo]