Paket: lighter (1.1.3-1 och andra)

[ Källkod: lighter  ]

fast and memory-efficient sequencing error corrector

Lighter is a fast, memory-efficient tool for correcting sequencing errors. Lighter avoids counting k-mers. Instead, it uses a pair of Bloom filters, one holding a sample of the input k-mers and the other holding k-mers likely to be correct. As long as the sampling fraction is adjusted in inverse proportion to the depth of sequencing, Bloom filter size can be held constant while maintaining near-constant accuracy. Lighter is parallelized, uses no secondary storage, and is both faster and more memory-efficient than competing approaches while achieving comparable accuracy.

Andra paket besläktade med lighter

• dep: libc6 (>= 2.38) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC stödbibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC stödbibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ej armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Hämta lighter

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.1.3-1	48,8 kbyte	180,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.1.3-1	48,1 kbyte	132,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.1.3-1	45,6 kbyte	180,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.1.3-1	46,2 kbyte	123,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.1.3-1	46,0 kbyte	103,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	1.1.3-1	55,0 kbyte	132,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.1.3-1	50,8 kbyte	135,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.1.2-7	56,1 kbyte	185,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.1.3-1	47,9 kbyte	131,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.1.3-1	49,2 kbyte	182,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1.1.3-1	50,7 kbyte	180,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.1.3-1	51,1 kbyte	180,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.1.3-1	47,6 kbyte	108,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.1.3-1	53,7 kbyte	140,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.1.3-1	60,1 kbyte	179,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1.1.3-1	49,9 kbyte	1.078,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1.1.3-1	47,9 kbyte	123,0 kbyte	[filförteckning]