Пакет: lighter (1.1.3-1 и другие)

[ Источник: lighter  ]

fast and memory-efficient sequencing error corrector

Lighter is a fast, memory-efficient tool for correcting sequencing errors. Lighter avoids counting k-mers. Instead, it uses a pair of Bloom filters, one holding a sample of the input k-mers and the other holding k-mers likely to be correct. As long as the sampling fraction is adjusted in inverse proportion to the depth of sequencing, Bloom filter size can be held constant while maintaining near-constant accuracy. Lighter is parallelized, uses no secondary storage, and is both faster and more memory-efficient than competing approaches while achieving comparable accuracy.

Другие пакеты, относящиеся к lighter

• dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [не armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  библиотека сжатия

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Загрузка lighter

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.1.3-1	48,8 Кб	180,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.1.3-1	48,1 Кб	132,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.1.3-1	45,6 Кб	180,0 Кб	[список файлов]
armel	1.1.3-1	46,2 Кб	123,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.1.3-1	46,0 Кб	103,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.1.3-1	55,0 Кб	132,0 Кб	[список файлов]
i386	1.1.3-1	50,8 Кб	135,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.1.2-7	56,1 Кб	185,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	1.1.3-1	48,9 Кб	132,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.1.3-1	47,9 Кб	131,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.1.3-1	49,2 Кб	182,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.1.3-1	50,7 Кб	180,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.1.3-1	51,1 Кб	180,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.1.3-1	47,6 Кб	108,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.1.3-1	53,7 Кб	140,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.1.3-1	60,1 Кб	179,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.1.3-1	49,9 Кб	1 078,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.1.3-1	47,9 Кб	123,0 Кб	[список файлов]