Paket: sniffles (1.0.12b+ds-1)

[ Källkod: sniffles  ]

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Andra paket besläktade med sniffles

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

Hämta sniffles

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	703,3 kbyte	1.100,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	681,9 kbyte	1.040,0 kbyte	[filförteckning]
armel	674,2 kbyte	1.027,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	680,5 kbyte	899,0 kbyte	[filförteckning]
i386	717,0 kbyte	1.127,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	680,8 kbyte	1.166,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	682,9 kbyte	1.147,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	707,2 kbyte	1.196,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	679,3 kbyte	1.100,0 kbyte	[filförteckning]